Protein–RNA interactions for Protein: Q96HM7

PCED1B, PC-esterase domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCED1BQ96HM7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCED1BQ96HM7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCED1BQ96HM7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCED1BQ96HM7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCED1BQ96HM7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCED1BQ96HM7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCED1BQ96HM7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCED1BQ96HM7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCED1BQ96HM7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCED1BQ96HM7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCED1BQ96HM7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCED1BQ96HM7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PCED1BQ96HM7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCED1BQ96HM7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCED1BQ96HM7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCED1BQ96HM7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCED1BQ96HM7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCED1BQ96HM7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCED1BQ96HM7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCED1BQ96HM7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCED1BQ96HM7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCED1BQ96HM7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCED1BQ96HM7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCED1BQ96HM7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCED1BQ96HM7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCED1BQ96HM7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCED1BQ96HM7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PCED1BQ96HM7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PCED1BQ96HM7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PCED1BQ96HM7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PCED1BQ96HM7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PCED1BQ96HM7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCED1BQ96HM7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCED1BQ96HM7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCED1BQ96HM7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCED1BQ96HM7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCED1BQ96HM7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCED1BQ96HM7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCED1BQ96HM7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCED1BQ96HM7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCED1BQ96HM7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCED1BQ96HM7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCED1BQ96HM7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCED1BQ96HM7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCED1BQ96HM7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCED1BQ96HM7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCED1BQ96HM7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCED1BQ96HM7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCED1BQ96HM7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCED1BQ96HM7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCED1BQ96HM7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCED1BQ96HM7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCED1BQ96HM7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCED1BQ96HM7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCED1BQ96HM7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PCED1BQ96HM7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCED1BQ96HM7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PCED1BQ96HM7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCED1BQ96HM7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCED1BQ96HM7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCED1BQ96HM7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCED1BQ96HM7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCED1BQ96HM7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCED1BQ96HM7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCED1BQ96HM7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCED1BQ96HM7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCED1BQ96HM7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCED1BQ96HM7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCED1BQ96HM7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCED1BQ96HM7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PCED1BQ96HM7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCED1BQ96HM7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCED1BQ96HM7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCED1BQ96HM7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCED1BQ96HM7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PCED1BQ96HM7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PCED1BQ96HM7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PCED1BQ96HM7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCED1BQ96HM7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCED1BQ96HM7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCED1BQ96HM7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCED1BQ96HM7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCED1BQ96HM7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCED1BQ96HM7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCED1BQ96HM7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCED1BQ96HM7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCED1BQ96HM7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCED1BQ96HM7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PCED1BQ96HM7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PCED1BQ96HM7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCED1BQ96HM7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCED1BQ96HM7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCED1BQ96HM7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCED1BQ96HM7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCED1BQ96HM7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCED1BQ96HM7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCED1BQ96HM7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCED1BQ96HM7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCED1BQ96HM7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCED1BQ96HM7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms