Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
LTV1Q96GA3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
LTV1Q96GA3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
LTV1Q96GA3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
LTV1Q96GA3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
LTV1Q96GA3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
LTV1Q96GA3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
LTV1Q96GA3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
LTV1Q96GA3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
LTV1Q96GA3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
LTV1Q96GA3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.67
LTV1Q96GA3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.66
LTV1Q96GA3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.66
LTV1Q96GA3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
LTV1Q96GA3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
LTV1Q96GA3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
LTV1Q96GA3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
LTV1Q96GA3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
LTV1Q96GA3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
LTV1Q96GA3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
LTV1Q96GA3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
LTV1Q96GA3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
LTV1Q96GA3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
LTV1Q96GA3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
LTV1Q96GA3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
LTV1Q96GA3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
LTV1Q96GA3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
LTV1Q96GA3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
LTV1Q96GA3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
LTV1Q96GA3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
LTV1Q96GA3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
LTV1Q96GA3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
LTV1Q96GA3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
LTV1Q96GA3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
LTV1Q96GA3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
LTV1Q96GA3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
LTV1Q96GA3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
LTV1Q96GA3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC31.66■■■□□ 2.66
LTV1Q96GA3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
LTV1Q96GA3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
LTV1Q96GA3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
LTV1Q96GA3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
LTV1Q96GA3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
LTV1Q96GA3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
LTV1Q96GA3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
LTV1Q96GA3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
LTV1Q96GA3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
LTV1Q96GA3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
LTV1Q96GA3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
LTV1Q96GA3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
LTV1Q96GA3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
LTV1Q96GA3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
LTV1Q96GA3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
LTV1Q96GA3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
LTV1Q96GA3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
LTV1Q96GA3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
LTV1Q96GA3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
LTV1Q96GA3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
LTV1Q96GA3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
LTV1Q96GA3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
LTV1Q96GA3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
LTV1Q96GA3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
LTV1Q96GA3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
LTV1Q96GA3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
LTV1Q96GA3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
LTV1Q96GA3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
LTV1Q96GA3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
LTV1Q96GA3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
LTV1Q96GA3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
LTV1Q96GA3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
LTV1Q96GA3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
LTV1Q96GA3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
LTV1Q96GA3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
LTV1Q96GA3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
LTV1Q96GA3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
LTV1Q96GA3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
LTV1Q96GA3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
LTV1Q96GA3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
LTV1Q96GA3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
LTV1Q96GA3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
LTV1Q96GA3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
LTV1Q96GA3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
LTV1Q96GA3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
LTV1Q96GA3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
LTV1Q96GA3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
LTV1Q96GA3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
LTV1Q96GA3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
LTV1Q96GA3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
LTV1Q96GA3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
LTV1Q96GA3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
LTV1Q96GA3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
LTV1Q96GA3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
LTV1Q96GA3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
LTV1Q96GA3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
LTV1Q96GA3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
LTV1Q96GA3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
LTV1Q96GA3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
LTV1Q96GA3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
LTV1Q96GA3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
LTV1Q96GA3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms