Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC97Q96F63 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC97Q96F63 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC97Q96F63 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC97Q96F63 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC97Q96F63 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC97Q96F63 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC97Q96F63 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC97Q96F63 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC97Q96F63 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC97Q96F63 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC97Q96F63 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC97Q96F63 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC97Q96F63 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC97Q96F63 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC97Q96F63 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC97Q96F63 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC97Q96F63 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC97Q96F63 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC97Q96F63 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC97Q96F63 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC97Q96F63 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC97Q96F63 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC97Q96F63 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC97Q96F63 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC97Q96F63 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC97Q96F63 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC97Q96F63 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC97Q96F63 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC97Q96F63 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC97Q96F63 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC97Q96F63 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC97Q96F63 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC97Q96F63 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC97Q96F63 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC97Q96F63 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC97Q96F63 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC97Q96F63 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC97Q96F63 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC97Q96F63 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC97Q96F63 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC97Q96F63 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC97Q96F63 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC97Q96F63 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC97Q96F63 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC97Q96F63 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC97Q96F63 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC97Q96F63 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC97Q96F63 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC97Q96F63 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC97Q96F63 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC97Q96F63 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC97Q96F63 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC97Q96F63 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC97Q96F63 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC97Q96F63 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC97Q96F63 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC97Q96F63 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC97Q96F63 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC97Q96F63 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC97Q96F63 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC97Q96F63 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC97Q96F63 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC97Q96F63 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC97Q96F63 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC97Q96F63 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC97Q96F63 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC97Q96F63 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC97Q96F63 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC97Q96F63 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC97Q96F63 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC97Q96F63 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC97Q96F63 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC97Q96F63 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC97Q96F63 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC97Q96F63 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC97Q96F63 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC97Q96F63 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC97Q96F63 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC97Q96F63 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC97Q96F63 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC97Q96F63 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC97Q96F63 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC97Q96F63 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC97Q96F63 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC97Q96F63 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC97Q96F63 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC97Q96F63 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC97Q96F63 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC97Q96F63 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC97Q96F63 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC97Q96F63 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC97Q96F63 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC97Q96F63 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC97Q96F63 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC97Q96F63 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC97Q96F63 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC97Q96F63 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC97Q96F63 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC97Q96F63 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms