Protein–RNA interactions for Protein: Q96E22

NUS1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit NUS1, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUS1Q96E22 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUS1Q96E22 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NUS1Q96E22 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUS1Q96E22 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NUS1Q96E22 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUS1Q96E22 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUS1Q96E22 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUS1Q96E22 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUS1Q96E22 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUS1Q96E22 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUS1Q96E22 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUS1Q96E22 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUS1Q96E22 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUS1Q96E22 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUS1Q96E22 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUS1Q96E22 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUS1Q96E22 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUS1Q96E22 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUS1Q96E22 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUS1Q96E22 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUS1Q96E22 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUS1Q96E22 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUS1Q96E22 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUS1Q96E22 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUS1Q96E22 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUS1Q96E22 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUS1Q96E22 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUS1Q96E22 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUS1Q96E22 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUS1Q96E22 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUS1Q96E22 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUS1Q96E22 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUS1Q96E22 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUS1Q96E22 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUS1Q96E22 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUS1Q96E22 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUS1Q96E22 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUS1Q96E22 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUS1Q96E22 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUS1Q96E22 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NUS1Q96E22 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUS1Q96E22 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUS1Q96E22 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUS1Q96E22 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUS1Q96E22 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUS1Q96E22 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUS1Q96E22 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUS1Q96E22 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUS1Q96E22 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NUS1Q96E22 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUS1Q96E22 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUS1Q96E22 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUS1Q96E22 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUS1Q96E22 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUS1Q96E22 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUS1Q96E22 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUS1Q96E22 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUS1Q96E22 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUS1Q96E22 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUS1Q96E22 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUS1Q96E22 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUS1Q96E22 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUS1Q96E22 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUS1Q96E22 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUS1Q96E22 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUS1Q96E22 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUS1Q96E22 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUS1Q96E22 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUS1Q96E22 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUS1Q96E22 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUS1Q96E22 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUS1Q96E22 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUS1Q96E22 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUS1Q96E22 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUS1Q96E22 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NUS1Q96E22 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUS1Q96E22 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUS1Q96E22 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUS1Q96E22 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUS1Q96E22 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NUS1Q96E22 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUS1Q96E22 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUS1Q96E22 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUS1Q96E22 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUS1Q96E22 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUS1Q96E22 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUS1Q96E22 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUS1Q96E22 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUS1Q96E22 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUS1Q96E22 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUS1Q96E22 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUS1Q96E22 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUS1Q96E22 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUS1Q96E22 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NUS1Q96E22 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NUS1Q96E22 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUS1Q96E22 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUS1Q96E22 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUS1Q96E22 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUS1Q96E22 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms