Protein–RNA interactions for Protein: Q96CV9

OPTN, Optineurin, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTNQ96CV9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
OPTNQ96CV9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
OPTNQ96CV9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
OPTNQ96CV9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
OPTNQ96CV9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
OPTNQ96CV9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
OPTNQ96CV9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
OPTNQ96CV9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
OPTNQ96CV9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
OPTNQ96CV9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
OPTNQ96CV9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
OPTNQ96CV9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
OPTNQ96CV9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
OPTNQ96CV9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
OPTNQ96CV9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
OPTNQ96CV9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
OPTNQ96CV9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
OPTNQ96CV9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
OPTNQ96CV9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
OPTNQ96CV9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
OPTNQ96CV9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
OPTNQ96CV9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
OPTNQ96CV9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
OPTNQ96CV9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
OPTNQ96CV9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
OPTNQ96CV9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
OPTNQ96CV9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
OPTNQ96CV9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
OPTNQ96CV9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
OPTNQ96CV9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
OPTNQ96CV9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
OPTNQ96CV9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
OPTNQ96CV9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
OPTNQ96CV9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
OPTNQ96CV9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
OPTNQ96CV9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
OPTNQ96CV9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
OPTNQ96CV9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
OPTNQ96CV9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
OPTNQ96CV9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
OPTNQ96CV9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
OPTNQ96CV9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
OPTNQ96CV9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
OPTNQ96CV9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
OPTNQ96CV9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
OPTNQ96CV9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
OPTNQ96CV9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
OPTNQ96CV9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
OPTNQ96CV9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
OPTNQ96CV9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
OPTNQ96CV9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
OPTNQ96CV9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
OPTNQ96CV9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
OPTNQ96CV9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
OPTNQ96CV9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
OPTNQ96CV9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
OPTNQ96CV9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
OPTNQ96CV9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
OPTNQ96CV9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
OPTNQ96CV9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
OPTNQ96CV9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
OPTNQ96CV9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
OPTNQ96CV9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
OPTNQ96CV9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
OPTNQ96CV9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
OPTNQ96CV9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
OPTNQ96CV9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
OPTNQ96CV9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
OPTNQ96CV9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
OPTNQ96CV9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
OPTNQ96CV9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
OPTNQ96CV9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
OPTNQ96CV9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
OPTNQ96CV9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
OPTNQ96CV9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
OPTNQ96CV9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
OPTNQ96CV9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
OPTNQ96CV9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
OPTNQ96CV9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
OPTNQ96CV9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
OPTNQ96CV9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
OPTNQ96CV9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
OPTNQ96CV9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
OPTNQ96CV9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
OPTNQ96CV9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
OPTNQ96CV9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
OPTNQ96CV9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
OPTNQ96CV9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
OPTNQ96CV9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
OPTNQ96CV9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
OPTNQ96CV9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
OPTNQ96CV9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
OPTNQ96CV9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
OPTNQ96CV9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
OPTNQ96CV9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
OPTNQ96CV9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
OPTNQ96CV9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
OPTNQ96CV9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
OPTNQ96CV9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
OPTNQ96CV9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms