Protein–RNA interactions for Protein: Q969G2

LHX4, LIM/homeobox protein Lhx4, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX4Q969G2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LHX4Q969G2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LHX4Q969G2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LHX4Q969G2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LHX4Q969G2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LHX4Q969G2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LHX4Q969G2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LHX4Q969G2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LHX4Q969G2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LHX4Q969G2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LHX4Q969G2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LHX4Q969G2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LHX4Q969G2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LHX4Q969G2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LHX4Q969G2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LHX4Q969G2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LHX4Q969G2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LHX4Q969G2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LHX4Q969G2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LHX4Q969G2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LHX4Q969G2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
LHX4Q969G2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LHX4Q969G2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LHX4Q969G2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LHX4Q969G2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LHX4Q969G2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LHX4Q969G2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LHX4Q969G2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
LHX4Q969G2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LHX4Q969G2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LHX4Q969G2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LHX4Q969G2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LHX4Q969G2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LHX4Q969G2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LHX4Q969G2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LHX4Q969G2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms