Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
GTF3C6Q969F1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
GTF3C6Q969F1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GTF3C6Q969F1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
GTF3C6Q969F1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
GTF3C6Q969F1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
GTF3C6Q969F1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GTF3C6Q969F1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GTF3C6Q969F1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GTF3C6Q969F1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GTF3C6Q969F1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GTF3C6Q969F1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GTF3C6Q969F1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GTF3C6Q969F1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GTF3C6Q969F1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GTF3C6Q969F1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GTF3C6Q969F1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GTF3C6Q969F1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GTF3C6Q969F1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GTF3C6Q969F1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GTF3C6Q969F1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GTF3C6Q969F1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GTF3C6Q969F1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GTF3C6Q969F1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GTF3C6Q969F1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GTF3C6Q969F1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GTF3C6Q969F1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
GTF3C6Q969F1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GTF3C6Q969F1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GTF3C6Q969F1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GTF3C6Q969F1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GTF3C6Q969F1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GTF3C6Q969F1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GTF3C6Q969F1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GTF3C6Q969F1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GTF3C6Q969F1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GTF3C6Q969F1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
GTF3C6Q969F1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.57■■■□□ 2
GTF3C6Q969F1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GTF3C6Q969F1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GTF3C6Q969F1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GTF3C6Q969F1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GTF3C6Q969F1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GTF3C6Q969F1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GTF3C6Q969F1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GTF3C6Q969F1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
GTF3C6Q969F1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GTF3C6Q969F1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GTF3C6Q969F1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GTF3C6Q969F1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
GTF3C6Q969F1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
GTF3C6Q969F1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GTF3C6Q969F1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GTF3C6Q969F1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GTF3C6Q969F1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GTF3C6Q969F1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GTF3C6Q969F1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GTF3C6Q969F1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GTF3C6Q969F1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GTF3C6Q969F1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GTF3C6Q969F1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GTF3C6Q969F1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GTF3C6Q969F1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GTF3C6Q969F1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GTF3C6Q969F1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GTF3C6Q969F1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GTF3C6Q969F1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GTF3C6Q969F1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GTF3C6Q969F1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GTF3C6Q969F1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GTF3C6Q969F1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GTF3C6Q969F1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GTF3C6Q969F1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
GTF3C6Q969F1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
GTF3C6Q969F1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GTF3C6Q969F1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GTF3C6Q969F1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GTF3C6Q969F1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF3C6Q969F1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF3C6Q969F1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF3C6Q969F1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF3C6Q969F1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF3C6Q969F1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF3C6Q969F1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF3C6Q969F1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF3C6Q969F1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF3C6Q969F1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF3C6Q969F1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF3C6Q969F1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF3C6Q969F1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF3C6Q969F1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF3C6Q969F1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF3C6Q969F1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF3C6Q969F1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF3C6Q969F1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF3C6Q969F1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF3C6Q969F1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF3C6Q969F1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF3C6Q969F1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GTF3C6Q969F1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 467.7 ms