Protein–RNA interactions for Protein: Q92832

NELL1, Protein kinase C-binding protein NELL1, humanhuman

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELL1Q92832 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NELL1Q92832 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NELL1Q92832 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NELL1Q92832 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NELL1Q92832 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NELL1Q92832 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NELL1Q92832 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NELL1Q92832 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NELL1Q92832 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NELL1Q92832 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NELL1Q92832 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NELL1Q92832 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NELL1Q92832 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NELL1Q92832 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NELL1Q92832 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NELL1Q92832 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NELL1Q92832 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NELL1Q92832 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NELL1Q92832 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NELL1Q92832 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NELL1Q92832 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NELL1Q92832 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NELL1Q92832 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NELL1Q92832 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NELL1Q92832 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NELL1Q92832 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NELL1Q92832 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NELL1Q92832 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NELL1Q92832 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NELL1Q92832 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NELL1Q92832 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NELL1Q92832 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NELL1Q92832 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NELL1Q92832 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NELL1Q92832 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NELL1Q92832 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NELL1Q92832 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NELL1Q92832 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NELL1Q92832 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NELL1Q92832 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NELL1Q92832 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NELL1Q92832 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NELL1Q92832 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NELL1Q92832 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NELL1Q92832 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NELL1Q92832 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NELL1Q92832 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NELL1Q92832 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NELL1Q92832 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NELL1Q92832 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NELL1Q92832 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NELL1Q92832 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NELL1Q92832 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NELL1Q92832 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NELL1Q92832 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NELL1Q92832 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NELL1Q92832 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NELL1Q92832 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NELL1Q92832 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NELL1Q92832 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NELL1Q92832 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NELL1Q92832 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NELL1Q92832 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NELL1Q92832 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NELL1Q92832 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NELL1Q92832 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NELL1Q92832 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NELL1Q92832 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NELL1Q92832 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NELL1Q92832 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NELL1Q92832 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NELL1Q92832 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NELL1Q92832 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NELL1Q92832 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NELL1Q92832 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NELL1Q92832 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NELL1Q92832 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NELL1Q92832 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NELL1Q92832 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NELL1Q92832 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
NELL1Q92832 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NELL1Q92832 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NELL1Q92832 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NELL1Q92832 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NELL1Q92832 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NELL1Q92832 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NELL1Q92832 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NELL1Q92832 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NELL1Q92832 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NELL1Q92832 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NELL1Q92832 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NELL1Q92832 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NELL1Q92832 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NELL1Q92832 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NELL1Q92832 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NELL1Q92832 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NELL1Q92832 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NELL1Q92832 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NELL1Q92832 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NELL1Q92832 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms