Protein–RNA interactions for Protein: Q92743

HTRA1, Serine protease HTRA1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA1Q92743 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HTRA1Q92743 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HTRA1Q92743 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HTRA1Q92743 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HTRA1Q92743 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HTRA1Q92743 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HTRA1Q92743 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HTRA1Q92743 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HTRA1Q92743 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HTRA1Q92743 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HTRA1Q92743 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HTRA1Q92743 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HTRA1Q92743 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HTRA1Q92743 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HTRA1Q92743 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HTRA1Q92743 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HTRA1Q92743 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HTRA1Q92743 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HTRA1Q92743 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HTRA1Q92743 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HTRA1Q92743 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HTRA1Q92743 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HTRA1Q92743 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HTRA1Q92743 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HTRA1Q92743 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HTRA1Q92743 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HTRA1Q92743 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HTRA1Q92743 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HTRA1Q92743 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HTRA1Q92743 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HTRA1Q92743 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HTRA1Q92743 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HTRA1Q92743 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HTRA1Q92743 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HTRA1Q92743 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HTRA1Q92743 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HTRA1Q92743 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HTRA1Q92743 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HTRA1Q92743 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HTRA1Q92743 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HTRA1Q92743 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTRA1Q92743 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTRA1Q92743 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTRA1Q92743 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTRA1Q92743 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTRA1Q92743 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTRA1Q92743 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTRA1Q92743 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTRA1Q92743 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTRA1Q92743 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTRA1Q92743 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTRA1Q92743 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTRA1Q92743 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTRA1Q92743 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTRA1Q92743 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTRA1Q92743 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTRA1Q92743 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTRA1Q92743 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTRA1Q92743 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
HTRA1Q92743 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTRA1Q92743 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTRA1Q92743 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTRA1Q92743 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTRA1Q92743 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HTRA1Q92743 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTRA1Q92743 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTRA1Q92743 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTRA1Q92743 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTRA1Q92743 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTRA1Q92743 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTRA1Q92743 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTRA1Q92743 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTRA1Q92743 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTRA1Q92743 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTRA1Q92743 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTRA1Q92743 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTRA1Q92743 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTRA1Q92743 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTRA1Q92743 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTRA1Q92743 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTRA1Q92743 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTRA1Q92743 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTRA1Q92743 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTRA1Q92743 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTRA1Q92743 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTRA1Q92743 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTRA1Q92743 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTRA1Q92743 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTRA1Q92743 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTRA1Q92743 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTRA1Q92743 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTRA1Q92743 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTRA1Q92743 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTRA1Q92743 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTRA1Q92743 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTRA1Q92743 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTRA1Q92743 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTRA1Q92743 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTRA1Q92743 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTRA1Q92743 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms