Protein–RNA interactions for Protein: Q92543

SNX19, Sorting nexin-19, humanhuman

Predictions only

Length 992 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX19Q92543 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX19Q92543 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX19Q92543 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX19Q92543 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX19Q92543 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX19Q92543 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX19Q92543 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX19Q92543 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX19Q92543 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX19Q92543 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX19Q92543 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX19Q92543 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX19Q92543 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX19Q92543 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX19Q92543 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX19Q92543 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX19Q92543 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX19Q92543 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX19Q92543 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX19Q92543 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX19Q92543 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX19Q92543 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX19Q92543 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX19Q92543 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX19Q92543 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX19Q92543 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX19Q92543 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX19Q92543 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX19Q92543 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX19Q92543 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX19Q92543 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX19Q92543 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX19Q92543 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX19Q92543 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX19Q92543 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX19Q92543 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX19Q92543 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX19Q92543 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX19Q92543 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX19Q92543 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX19Q92543 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX19Q92543 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX19Q92543 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX19Q92543 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX19Q92543 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX19Q92543 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX19Q92543 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX19Q92543 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX19Q92543 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX19Q92543 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX19Q92543 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX19Q92543 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX19Q92543 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX19Q92543 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX19Q92543 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX19Q92543 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX19Q92543 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX19Q92543 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX19Q92543 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX19Q92543 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX19Q92543 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX19Q92543 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX19Q92543 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX19Q92543 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX19Q92543 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX19Q92543 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX19Q92543 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX19Q92543 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX19Q92543 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX19Q92543 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX19Q92543 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX19Q92543 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX19Q92543 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX19Q92543 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX19Q92543 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX19Q92543 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX19Q92543 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX19Q92543 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX19Q92543 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX19Q92543 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX19Q92543 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX19Q92543 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX19Q92543 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX19Q92543 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX19Q92543 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX19Q92543 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX19Q92543 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX19Q92543 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX19Q92543 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX19Q92543 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX19Q92543 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX19Q92543 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX19Q92543 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX19Q92543 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX19Q92543 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX19Q92543 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX19Q92543 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX19Q92543 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX19Q92543 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX19Q92543 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms