Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF1

C1orf54, Uncharacterized protein C1orf54, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf54Q8WWF1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1orf54Q8WWF1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1orf54Q8WWF1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1orf54Q8WWF1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1orf54Q8WWF1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1orf54Q8WWF1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1orf54Q8WWF1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1orf54Q8WWF1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1orf54Q8WWF1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1orf54Q8WWF1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1orf54Q8WWF1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
C1orf54Q8WWF1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1orf54Q8WWF1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1orf54Q8WWF1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1orf54Q8WWF1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
C1orf54Q8WWF1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1orf54Q8WWF1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1orf54Q8WWF1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1orf54Q8WWF1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1orf54Q8WWF1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1orf54Q8WWF1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1orf54Q8WWF1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1orf54Q8WWF1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1orf54Q8WWF1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1orf54Q8WWF1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1orf54Q8WWF1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1orf54Q8WWF1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1orf54Q8WWF1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1orf54Q8WWF1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1orf54Q8WWF1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
C1orf54Q8WWF1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1orf54Q8WWF1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1orf54Q8WWF1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1orf54Q8WWF1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1orf54Q8WWF1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1orf54Q8WWF1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1orf54Q8WWF1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1orf54Q8WWF1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1orf54Q8WWF1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1orf54Q8WWF1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1orf54Q8WWF1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
C1orf54Q8WWF1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1orf54Q8WWF1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1orf54Q8WWF1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1orf54Q8WWF1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1orf54Q8WWF1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1orf54Q8WWF1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1orf54Q8WWF1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1orf54Q8WWF1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1orf54Q8WWF1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1orf54Q8WWF1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1orf54Q8WWF1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1orf54Q8WWF1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1orf54Q8WWF1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1orf54Q8WWF1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1orf54Q8WWF1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1orf54Q8WWF1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1orf54Q8WWF1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1orf54Q8WWF1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1orf54Q8WWF1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1orf54Q8WWF1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1orf54Q8WWF1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1orf54Q8WWF1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1orf54Q8WWF1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1orf54Q8WWF1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf54Q8WWF1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf54Q8WWF1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf54Q8WWF1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf54Q8WWF1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf54Q8WWF1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf54Q8WWF1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf54Q8WWF1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf54Q8WWF1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf54Q8WWF1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf54Q8WWF1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf54Q8WWF1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf54Q8WWF1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C1orf54Q8WWF1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C1orf54Q8WWF1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1orf54Q8WWF1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1orf54Q8WWF1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1orf54Q8WWF1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1orf54Q8WWF1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf54Q8WWF1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf54Q8WWF1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf54Q8WWF1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf54Q8WWF1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf54Q8WWF1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf54Q8WWF1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf54Q8WWF1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf54Q8WWF1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf54Q8WWF1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1orf54Q8WWF1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1orf54Q8WWF1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1orf54Q8WWF1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1orf54Q8WWF1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1orf54Q8WWF1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1orf54Q8WWF1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf54Q8WWF1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf54Q8WWF1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
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