Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVP7

LMBR1, Limb region 1 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1Q8WVP7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMBR1Q8WVP7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMBR1Q8WVP7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMBR1Q8WVP7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMBR1Q8WVP7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMBR1Q8WVP7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMBR1Q8WVP7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LMBR1Q8WVP7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMBR1Q8WVP7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMBR1Q8WVP7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMBR1Q8WVP7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMBR1Q8WVP7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMBR1Q8WVP7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMBR1Q8WVP7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMBR1Q8WVP7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMBR1Q8WVP7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMBR1Q8WVP7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMBR1Q8WVP7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMBR1Q8WVP7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMBR1Q8WVP7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMBR1Q8WVP7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMBR1Q8WVP7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMBR1Q8WVP7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMBR1Q8WVP7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMBR1Q8WVP7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMBR1Q8WVP7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMBR1Q8WVP7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMBR1Q8WVP7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMBR1Q8WVP7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMBR1Q8WVP7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMBR1Q8WVP7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMBR1Q8WVP7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMBR1Q8WVP7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMBR1Q8WVP7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMBR1Q8WVP7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMBR1Q8WVP7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMBR1Q8WVP7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LMBR1Q8WVP7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMBR1Q8WVP7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
LMBR1Q8WVP7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMBR1Q8WVP7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMBR1Q8WVP7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMBR1Q8WVP7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMBR1Q8WVP7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
LMBR1Q8WVP7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMBR1Q8WVP7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMBR1Q8WVP7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMBR1Q8WVP7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMBR1Q8WVP7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMBR1Q8WVP7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMBR1Q8WVP7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMBR1Q8WVP7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMBR1Q8WVP7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMBR1Q8WVP7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LMBR1Q8WVP7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMBR1Q8WVP7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMBR1Q8WVP7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMBR1Q8WVP7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMBR1Q8WVP7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMBR1Q8WVP7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMBR1Q8WVP7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMBR1Q8WVP7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMBR1Q8WVP7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMBR1Q8WVP7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMBR1Q8WVP7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LMBR1Q8WVP7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMBR1Q8WVP7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMBR1Q8WVP7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMBR1Q8WVP7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMBR1Q8WVP7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LMBR1Q8WVP7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMBR1Q8WVP7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMBR1Q8WVP7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMBR1Q8WVP7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMBR1Q8WVP7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMBR1Q8WVP7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMBR1Q8WVP7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LMBR1Q8WVP7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMBR1Q8WVP7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMBR1Q8WVP7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LMBR1Q8WVP7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMBR1Q8WVP7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMBR1Q8WVP7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMBR1Q8WVP7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMBR1Q8WVP7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMBR1Q8WVP7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMBR1Q8WVP7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMBR1Q8WVP7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMBR1Q8WVP7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMBR1Q8WVP7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMBR1Q8WVP7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMBR1Q8WVP7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMBR1Q8WVP7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMBR1Q8WVP7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMBR1Q8WVP7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMBR1Q8WVP7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMBR1Q8WVP7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMBR1Q8WVP7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMBR1Q8WVP7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMBR1Q8WVP7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms