Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV41

SNX33, Sorting nexin-33, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX33Q8WV41 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX33Q8WV41 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX33Q8WV41 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX33Q8WV41 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX33Q8WV41 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX33Q8WV41 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX33Q8WV41 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX33Q8WV41 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX33Q8WV41 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX33Q8WV41 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX33Q8WV41 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX33Q8WV41 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX33Q8WV41 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX33Q8WV41 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX33Q8WV41 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX33Q8WV41 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX33Q8WV41 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX33Q8WV41 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX33Q8WV41 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX33Q8WV41 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX33Q8WV41 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX33Q8WV41 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX33Q8WV41 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX33Q8WV41 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX33Q8WV41 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX33Q8WV41 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX33Q8WV41 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX33Q8WV41 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX33Q8WV41 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX33Q8WV41 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX33Q8WV41 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX33Q8WV41 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX33Q8WV41 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX33Q8WV41 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX33Q8WV41 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX33Q8WV41 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX33Q8WV41 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SNX33Q8WV41 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SNX33Q8WV41 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SNX33Q8WV41 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX33Q8WV41 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX33Q8WV41 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX33Q8WV41 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX33Q8WV41 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX33Q8WV41 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX33Q8WV41 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX33Q8WV41 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX33Q8WV41 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX33Q8WV41 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX33Q8WV41 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX33Q8WV41 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX33Q8WV41 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX33Q8WV41 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX33Q8WV41 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX33Q8WV41 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX33Q8WV41 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX33Q8WV41 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX33Q8WV41 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX33Q8WV41 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX33Q8WV41 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX33Q8WV41 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX33Q8WV41 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX33Q8WV41 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX33Q8WV41 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX33Q8WV41 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX33Q8WV41 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX33Q8WV41 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX33Q8WV41 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX33Q8WV41 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX33Q8WV41 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX33Q8WV41 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX33Q8WV41 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX33Q8WV41 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX33Q8WV41 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX33Q8WV41 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX33Q8WV41 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX33Q8WV41 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX33Q8WV41 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX33Q8WV41 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX33Q8WV41 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX33Q8WV41 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX33Q8WV41 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX33Q8WV41 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX33Q8WV41 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX33Q8WV41 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX33Q8WV41 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX33Q8WV41 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX33Q8WV41 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SNX33Q8WV41 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX33Q8WV41 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX33Q8WV41 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX33Q8WV41 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX33Q8WV41 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX33Q8WV41 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX33Q8WV41 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX33Q8WV41 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX33Q8WV41 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX33Q8WV41 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX33Q8WV41 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX33Q8WV41 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms