Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD19

NEK9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK9Q8TD19 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEK9Q8TD19 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEK9Q8TD19 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEK9Q8TD19 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEK9Q8TD19 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEK9Q8TD19 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEK9Q8TD19 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NEK9Q8TD19 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEK9Q8TD19 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEK9Q8TD19 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEK9Q8TD19 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEK9Q8TD19 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEK9Q8TD19 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEK9Q8TD19 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEK9Q8TD19 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
NEK9Q8TD19 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEK9Q8TD19 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NEK9Q8TD19 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEK9Q8TD19 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEK9Q8TD19 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEK9Q8TD19 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEK9Q8TD19 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEK9Q8TD19 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEK9Q8TD19 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEK9Q8TD19 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEK9Q8TD19 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEK9Q8TD19 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEK9Q8TD19 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEK9Q8TD19 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEK9Q8TD19 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEK9Q8TD19 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEK9Q8TD19 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEK9Q8TD19 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEK9Q8TD19 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEK9Q8TD19 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEK9Q8TD19 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEK9Q8TD19 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEK9Q8TD19 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEK9Q8TD19 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEK9Q8TD19 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEK9Q8TD19 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEK9Q8TD19 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEK9Q8TD19 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEK9Q8TD19 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NEK9Q8TD19 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEK9Q8TD19 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEK9Q8TD19 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEK9Q8TD19 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEK9Q8TD19 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEK9Q8TD19 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEK9Q8TD19 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEK9Q8TD19 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEK9Q8TD19 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEK9Q8TD19 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEK9Q8TD19 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEK9Q8TD19 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEK9Q8TD19 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NEK9Q8TD19 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEK9Q8TD19 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEK9Q8TD19 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEK9Q8TD19 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEK9Q8TD19 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEK9Q8TD19 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEK9Q8TD19 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEK9Q8TD19 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEK9Q8TD19 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEK9Q8TD19 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEK9Q8TD19 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEK9Q8TD19 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEK9Q8TD19 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEK9Q8TD19 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NEK9Q8TD19 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEK9Q8TD19 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEK9Q8TD19 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEK9Q8TD19 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEK9Q8TD19 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEK9Q8TD19 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEK9Q8TD19 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NEK9Q8TD19 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEK9Q8TD19 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEK9Q8TD19 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEK9Q8TD19 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEK9Q8TD19 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEK9Q8TD19 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEK9Q8TD19 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEK9Q8TD19 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEK9Q8TD19 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEK9Q8TD19 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NEK9Q8TD19 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEK9Q8TD19 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEK9Q8TD19 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEK9Q8TD19 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEK9Q8TD19 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEK9Q8TD19 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEK9Q8TD19 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEK9Q8TD19 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEK9Q8TD19 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEK9Q8TD19 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEK9Q8TD19 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEK9Q8TD19 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms