Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI35

PATJ, InaD-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATJQ8NI35 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PATJQ8NI35 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PATJQ8NI35 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PATJQ8NI35 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PATJQ8NI35 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PATJQ8NI35 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PATJQ8NI35 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PATJQ8NI35 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PATJQ8NI35 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PATJQ8NI35 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PATJQ8NI35 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PATJQ8NI35 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PATJQ8NI35 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PATJQ8NI35 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PATJQ8NI35 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PATJQ8NI35 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PATJQ8NI35 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PATJQ8NI35 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PATJQ8NI35 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PATJQ8NI35 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PATJQ8NI35 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PATJQ8NI35 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PATJQ8NI35 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PATJQ8NI35 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PATJQ8NI35 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PATJQ8NI35 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PATJQ8NI35 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PATJQ8NI35 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PATJQ8NI35 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PATJQ8NI35 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PATJQ8NI35 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PATJQ8NI35 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PATJQ8NI35 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PATJQ8NI35 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PATJQ8NI35 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PATJQ8NI35 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PATJQ8NI35 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PATJQ8NI35 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PATJQ8NI35 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PATJQ8NI35 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PATJQ8NI35 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PATJQ8NI35 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PATJQ8NI35 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PATJQ8NI35 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PATJQ8NI35 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PATJQ8NI35 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PATJQ8NI35 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PATJQ8NI35 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PATJQ8NI35 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PATJQ8NI35 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PATJQ8NI35 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PATJQ8NI35 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PATJQ8NI35 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PATJQ8NI35 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PATJQ8NI35 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PATJQ8NI35 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PATJQ8NI35 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PATJQ8NI35 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PATJQ8NI35 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PATJQ8NI35 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PATJQ8NI35 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PATJQ8NI35 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PATJQ8NI35 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PATJQ8NI35 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PATJQ8NI35 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PATJQ8NI35 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PATJQ8NI35 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PATJQ8NI35 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PATJQ8NI35 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PATJQ8NI35 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PATJQ8NI35 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PATJQ8NI35 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PATJQ8NI35 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PATJQ8NI35 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PATJQ8NI35 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PATJQ8NI35 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PATJQ8NI35 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PATJQ8NI35 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PATJQ8NI35 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PATJQ8NI35 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PATJQ8NI35 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PATJQ8NI35 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PATJQ8NI35 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PATJQ8NI35 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PATJQ8NI35 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PATJQ8NI35 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PATJQ8NI35 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PATJQ8NI35 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PATJQ8NI35 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PATJQ8NI35 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PATJQ8NI35 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PATJQ8NI35 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PATJQ8NI35 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PATJQ8NI35 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PATJQ8NI35 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PATJQ8NI35 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PATJQ8NI35 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PATJQ8NI35 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PATJQ8NI35 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PATJQ8NI35 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms