Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFZ8

CADM4, Cell adhesion molecule 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM4Q8NFZ8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CADM4Q8NFZ8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CADM4Q8NFZ8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CADM4Q8NFZ8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CADM4Q8NFZ8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CADM4Q8NFZ8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CADM4Q8NFZ8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CADM4Q8NFZ8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CADM4Q8NFZ8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CADM4Q8NFZ8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CADM4Q8NFZ8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CADM4Q8NFZ8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CADM4Q8NFZ8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CADM4Q8NFZ8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CADM4Q8NFZ8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CADM4Q8NFZ8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CADM4Q8NFZ8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CADM4Q8NFZ8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CADM4Q8NFZ8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CADM4Q8NFZ8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CADM4Q8NFZ8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CADM4Q8NFZ8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CADM4Q8NFZ8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CADM4Q8NFZ8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CADM4Q8NFZ8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CADM4Q8NFZ8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CADM4Q8NFZ8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CADM4Q8NFZ8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CADM4Q8NFZ8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CADM4Q8NFZ8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CADM4Q8NFZ8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CADM4Q8NFZ8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CADM4Q8NFZ8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CADM4Q8NFZ8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CADM4Q8NFZ8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CADM4Q8NFZ8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CADM4Q8NFZ8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CADM4Q8NFZ8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CADM4Q8NFZ8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CADM4Q8NFZ8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CADM4Q8NFZ8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CADM4Q8NFZ8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CADM4Q8NFZ8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CADM4Q8NFZ8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CADM4Q8NFZ8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CADM4Q8NFZ8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CADM4Q8NFZ8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CADM4Q8NFZ8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CADM4Q8NFZ8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CADM4Q8NFZ8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CADM4Q8NFZ8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CADM4Q8NFZ8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CADM4Q8NFZ8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CADM4Q8NFZ8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CADM4Q8NFZ8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CADM4Q8NFZ8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CADM4Q8NFZ8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CADM4Q8NFZ8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CADM4Q8NFZ8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CADM4Q8NFZ8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CADM4Q8NFZ8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CADM4Q8NFZ8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CADM4Q8NFZ8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CADM4Q8NFZ8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CADM4Q8NFZ8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CADM4Q8NFZ8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CADM4Q8NFZ8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CADM4Q8NFZ8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CADM4Q8NFZ8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CADM4Q8NFZ8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CADM4Q8NFZ8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CADM4Q8NFZ8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CADM4Q8NFZ8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CADM4Q8NFZ8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CADM4Q8NFZ8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CADM4Q8NFZ8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CADM4Q8NFZ8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CADM4Q8NFZ8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CADM4Q8NFZ8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CADM4Q8NFZ8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CADM4Q8NFZ8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CADM4Q8NFZ8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CADM4Q8NFZ8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CADM4Q8NFZ8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CADM4Q8NFZ8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CADM4Q8NFZ8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CADM4Q8NFZ8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CADM4Q8NFZ8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CADM4Q8NFZ8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CADM4Q8NFZ8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CADM4Q8NFZ8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CADM4Q8NFZ8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CADM4Q8NFZ8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CADM4Q8NFZ8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CADM4Q8NFZ8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CADM4Q8NFZ8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CADM4Q8NFZ8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CADM4Q8NFZ8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CADM4Q8NFZ8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CADM4Q8NFZ8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms