Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR3

SPTSSB, Serine palmitoyltransferase small subunit B, humanhuman

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Length 76 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSBQ8NFR3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTSSBQ8NFR3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTSSBQ8NFR3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTSSBQ8NFR3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTSSBQ8NFR3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTSSBQ8NFR3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTSSBQ8NFR3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTSSBQ8NFR3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTSSBQ8NFR3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTSSBQ8NFR3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTSSBQ8NFR3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTSSBQ8NFR3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTSSBQ8NFR3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTSSBQ8NFR3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTSSBQ8NFR3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTSSBQ8NFR3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTSSBQ8NFR3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTSSBQ8NFR3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTSSBQ8NFR3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTSSBQ8NFR3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTSSBQ8NFR3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTSSBQ8NFR3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTSSBQ8NFR3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTSSBQ8NFR3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTSSBQ8NFR3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTSSBQ8NFR3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTSSBQ8NFR3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTSSBQ8NFR3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTSSBQ8NFR3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTSSBQ8NFR3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTSSBQ8NFR3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTSSBQ8NFR3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTSSBQ8NFR3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTSSBQ8NFR3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTSSBQ8NFR3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTSSBQ8NFR3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTSSBQ8NFR3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTSSBQ8NFR3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTSSBQ8NFR3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTSSBQ8NFR3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTSSBQ8NFR3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTSSBQ8NFR3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTSSBQ8NFR3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTSSBQ8NFR3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTSSBQ8NFR3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTSSBQ8NFR3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTSSBQ8NFR3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTSSBQ8NFR3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTSSBQ8NFR3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTSSBQ8NFR3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTSSBQ8NFR3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTSSBQ8NFR3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SPTSSBQ8NFR3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SPTSSBQ8NFR3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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