Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEY3

SPATA4, Spermatogenesis-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA4Q8NEY3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPATA4Q8NEY3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPATA4Q8NEY3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPATA4Q8NEY3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SPATA4Q8NEY3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SPATA4Q8NEY3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPATA4Q8NEY3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPATA4Q8NEY3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPATA4Q8NEY3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPATA4Q8NEY3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPATA4Q8NEY3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPATA4Q8NEY3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPATA4Q8NEY3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPATA4Q8NEY3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPATA4Q8NEY3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPATA4Q8NEY3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SPATA4Q8NEY3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPATA4Q8NEY3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPATA4Q8NEY3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPATA4Q8NEY3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPATA4Q8NEY3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPATA4Q8NEY3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPATA4Q8NEY3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPATA4Q8NEY3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPATA4Q8NEY3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPATA4Q8NEY3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPATA4Q8NEY3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPATA4Q8NEY3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPATA4Q8NEY3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPATA4Q8NEY3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPATA4Q8NEY3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPATA4Q8NEY3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPATA4Q8NEY3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPATA4Q8NEY3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPATA4Q8NEY3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPATA4Q8NEY3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPATA4Q8NEY3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPATA4Q8NEY3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPATA4Q8NEY3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPATA4Q8NEY3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPATA4Q8NEY3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPATA4Q8NEY3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPATA4Q8NEY3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPATA4Q8NEY3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPATA4Q8NEY3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPATA4Q8NEY3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPATA4Q8NEY3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPATA4Q8NEY3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPATA4Q8NEY3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPATA4Q8NEY3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPATA4Q8NEY3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPATA4Q8NEY3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPATA4Q8NEY3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SPATA4Q8NEY3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SPATA4Q8NEY3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SPATA4Q8NEY3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SPATA4Q8NEY3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPATA4Q8NEY3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPATA4Q8NEY3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPATA4Q8NEY3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPATA4Q8NEY3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPATA4Q8NEY3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPATA4Q8NEY3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPATA4Q8NEY3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPATA4Q8NEY3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPATA4Q8NEY3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPATA4Q8NEY3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SPATA4Q8NEY3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPATA4Q8NEY3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPATA4Q8NEY3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPATA4Q8NEY3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPATA4Q8NEY3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPATA4Q8NEY3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPATA4Q8NEY3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPATA4Q8NEY3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPATA4Q8NEY3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPATA4Q8NEY3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPATA4Q8NEY3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPATA4Q8NEY3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPATA4Q8NEY3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPATA4Q8NEY3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPATA4Q8NEY3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPATA4Q8NEY3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPATA4Q8NEY3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPATA4Q8NEY3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPATA4Q8NEY3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPATA4Q8NEY3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPATA4Q8NEY3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPATA4Q8NEY3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPATA4Q8NEY3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPATA4Q8NEY3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPATA4Q8NEY3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPATA4Q8NEY3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPATA4Q8NEY3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPATA4Q8NEY3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPATA4Q8NEY3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPATA4Q8NEY3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPATA4Q8NEY3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPATA4Q8NEY3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPATA4Q8NEY3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms