Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND90

PNMA1, Paraneoplastic antigen Ma1, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA1Q8ND90 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PNMA1Q8ND90 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PNMA1Q8ND90 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PNMA1Q8ND90 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PNMA1Q8ND90 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PNMA1Q8ND90 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PNMA1Q8ND90 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PNMA1Q8ND90 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PNMA1Q8ND90 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PNMA1Q8ND90 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PNMA1Q8ND90 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PNMA1Q8ND90 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PNMA1Q8ND90 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PNMA1Q8ND90 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PNMA1Q8ND90 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PNMA1Q8ND90 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PNMA1Q8ND90 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PNMA1Q8ND90 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PNMA1Q8ND90 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PNMA1Q8ND90 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PNMA1Q8ND90 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PNMA1Q8ND90 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PNMA1Q8ND90 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PNMA1Q8ND90 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PNMA1Q8ND90 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PNMA1Q8ND90 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PNMA1Q8ND90 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PNMA1Q8ND90 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PNMA1Q8ND90 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PNMA1Q8ND90 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PNMA1Q8ND90 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PNMA1Q8ND90 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PNMA1Q8ND90 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PNMA1Q8ND90 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PNMA1Q8ND90 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PNMA1Q8ND90 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PNMA1Q8ND90 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PNMA1Q8ND90 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PNMA1Q8ND90 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PNMA1Q8ND90 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PNMA1Q8ND90 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PNMA1Q8ND90 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PNMA1Q8ND90 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PNMA1Q8ND90 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PNMA1Q8ND90 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PNMA1Q8ND90 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PNMA1Q8ND90 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PNMA1Q8ND90 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PNMA1Q8ND90 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PNMA1Q8ND90 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PNMA1Q8ND90 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PNMA1Q8ND90 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PNMA1Q8ND90 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
PNMA1Q8ND90 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PNMA1Q8ND90 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PNMA1Q8ND90 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PNMA1Q8ND90 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PNMA1Q8ND90 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PNMA1Q8ND90 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PNMA1Q8ND90 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PNMA1Q8ND90 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PNMA1Q8ND90 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PNMA1Q8ND90 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PNMA1Q8ND90 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PNMA1Q8ND90 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PNMA1Q8ND90 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PNMA1Q8ND90 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PNMA1Q8ND90 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PNMA1Q8ND90 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PNMA1Q8ND90 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PNMA1Q8ND90 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PNMA1Q8ND90 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PNMA1Q8ND90 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PNMA1Q8ND90 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PNMA1Q8ND90 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PNMA1Q8ND90 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PNMA1Q8ND90 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PNMA1Q8ND90 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PNMA1Q8ND90 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PNMA1Q8ND90 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PNMA1Q8ND90 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PNMA1Q8ND90 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PNMA1Q8ND90 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PNMA1Q8ND90 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PNMA1Q8ND90 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PNMA1Q8ND90 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PNMA1Q8ND90 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PNMA1Q8ND90 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PNMA1Q8ND90 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PNMA1Q8ND90 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PNMA1Q8ND90 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PNMA1Q8ND90 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PNMA1Q8ND90 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PNMA1Q8ND90 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PNMA1Q8ND90 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PNMA1Q8ND90 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PNMA1Q8ND90 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PNMA1Q8ND90 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PNMA1Q8ND90 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PNMA1Q8ND90 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms