Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HJURPQ8NCD3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HJURPQ8NCD3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HJURPQ8NCD3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HJURPQ8NCD3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HJURPQ8NCD3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HJURPQ8NCD3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HJURPQ8NCD3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HJURPQ8NCD3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HJURPQ8NCD3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HJURPQ8NCD3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HJURPQ8NCD3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HJURPQ8NCD3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HJURPQ8NCD3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HJURPQ8NCD3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HJURPQ8NCD3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HJURPQ8NCD3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HJURPQ8NCD3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HJURPQ8NCD3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HJURPQ8NCD3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HJURPQ8NCD3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HJURPQ8NCD3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HJURPQ8NCD3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HJURPQ8NCD3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HJURPQ8NCD3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HJURPQ8NCD3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HJURPQ8NCD3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HJURPQ8NCD3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HJURPQ8NCD3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HJURPQ8NCD3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HJURPQ8NCD3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HJURPQ8NCD3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HJURPQ8NCD3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HJURPQ8NCD3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HJURPQ8NCD3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HJURPQ8NCD3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HJURPQ8NCD3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HJURPQ8NCD3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HJURPQ8NCD3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HJURPQ8NCD3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HJURPQ8NCD3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HJURPQ8NCD3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HJURPQ8NCD3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HJURPQ8NCD3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HJURPQ8NCD3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HJURPQ8NCD3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HJURPQ8NCD3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HJURPQ8NCD3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HJURPQ8NCD3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HJURPQ8NCD3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HJURPQ8NCD3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HJURPQ8NCD3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HJURPQ8NCD3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HJURPQ8NCD3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HJURPQ8NCD3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HJURPQ8NCD3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HJURPQ8NCD3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HJURPQ8NCD3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HJURPQ8NCD3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HJURPQ8NCD3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HJURPQ8NCD3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HJURPQ8NCD3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HJURPQ8NCD3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HJURPQ8NCD3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HJURPQ8NCD3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HJURPQ8NCD3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HJURPQ8NCD3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HJURPQ8NCD3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HJURPQ8NCD3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HJURPQ8NCD3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HJURPQ8NCD3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HJURPQ8NCD3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HJURPQ8NCD3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HJURPQ8NCD3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HJURPQ8NCD3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HJURPQ8NCD3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HJURPQ8NCD3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HJURPQ8NCD3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HJURPQ8NCD3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HJURPQ8NCD3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HJURPQ8NCD3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HJURPQ8NCD3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HJURPQ8NCD3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HJURPQ8NCD3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HJURPQ8NCD3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HJURPQ8NCD3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HJURPQ8NCD3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HJURPQ8NCD3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HJURPQ8NCD3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HJURPQ8NCD3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HJURPQ8NCD3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HJURPQ8NCD3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HJURPQ8NCD3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HJURPQ8NCD3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HJURPQ8NCD3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HJURPQ8NCD3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HJURPQ8NCD3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HJURPQ8NCD3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HJURPQ8NCD3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HJURPQ8NCD3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms