Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM87AQ8NBN3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM87AQ8NBN3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM87AQ8NBN3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM87AQ8NBN3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM87AQ8NBN3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM87AQ8NBN3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM87AQ8NBN3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM87AQ8NBN3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM87AQ8NBN3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM87AQ8NBN3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM87AQ8NBN3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM87AQ8NBN3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
TMEM87AQ8NBN3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM87AQ8NBN3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM87AQ8NBN3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM87AQ8NBN3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM87AQ8NBN3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM87AQ8NBN3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM87AQ8NBN3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM87AQ8NBN3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM87AQ8NBN3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM87AQ8NBN3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM87AQ8NBN3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM87AQ8NBN3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM87AQ8NBN3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM87AQ8NBN3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM87AQ8NBN3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM87AQ8NBN3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM87AQ8NBN3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM87AQ8NBN3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM87AQ8NBN3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM87AQ8NBN3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM87AQ8NBN3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM87AQ8NBN3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM87AQ8NBN3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM87AQ8NBN3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMEM87AQ8NBN3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM87AQ8NBN3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM87AQ8NBN3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM87AQ8NBN3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM87AQ8NBN3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM87AQ8NBN3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM87AQ8NBN3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM87AQ8NBN3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM87AQ8NBN3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM87AQ8NBN3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM87AQ8NBN3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM87AQ8NBN3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM87AQ8NBN3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM87AQ8NBN3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM87AQ8NBN3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM87AQ8NBN3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM87AQ8NBN3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM87AQ8NBN3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM87AQ8NBN3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM87AQ8NBN3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM87AQ8NBN3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM87AQ8NBN3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM87AQ8NBN3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM87AQ8NBN3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM87AQ8NBN3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM87AQ8NBN3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM87AQ8NBN3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM87AQ8NBN3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM87AQ8NBN3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM87AQ8NBN3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM87AQ8NBN3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM87AQ8NBN3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM87AQ8NBN3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM87AQ8NBN3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM87AQ8NBN3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM87AQ8NBN3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM87AQ8NBN3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM87AQ8NBN3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM87AQ8NBN3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM87AQ8NBN3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM87AQ8NBN3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TMEM87AQ8NBN3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TMEM87AQ8NBN3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMEM87AQ8NBN3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMEM87AQ8NBN3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMEM87AQ8NBN3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMEM87AQ8NBN3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMEM87AQ8NBN3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMEM87AQ8NBN3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM87AQ8NBN3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM87AQ8NBN3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM87AQ8NBN3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM87AQ8NBN3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM87AQ8NBN3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM87AQ8NBN3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM87AQ8NBN3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM87AQ8NBN3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM87AQ8NBN3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM87AQ8NBN3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM87AQ8NBN3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM87AQ8NBN3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM87AQ8NBN3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM87AQ8NBN3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms