Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3E9

PLCD3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase delta-3, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCD3Q8N3E9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLCD3Q8N3E9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLCD3Q8N3E9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLCD3Q8N3E9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLCD3Q8N3E9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLCD3Q8N3E9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLCD3Q8N3E9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLCD3Q8N3E9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLCD3Q8N3E9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PLCD3Q8N3E9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLCD3Q8N3E9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PLCD3Q8N3E9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLCD3Q8N3E9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PLCD3Q8N3E9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLCD3Q8N3E9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLCD3Q8N3E9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLCD3Q8N3E9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLCD3Q8N3E9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLCD3Q8N3E9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLCD3Q8N3E9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLCD3Q8N3E9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLCD3Q8N3E9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLCD3Q8N3E9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PLCD3Q8N3E9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLCD3Q8N3E9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLCD3Q8N3E9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLCD3Q8N3E9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLCD3Q8N3E9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLCD3Q8N3E9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLCD3Q8N3E9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLCD3Q8N3E9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLCD3Q8N3E9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLCD3Q8N3E9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLCD3Q8N3E9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLCD3Q8N3E9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLCD3Q8N3E9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLCD3Q8N3E9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLCD3Q8N3E9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLCD3Q8N3E9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLCD3Q8N3E9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLCD3Q8N3E9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLCD3Q8N3E9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLCD3Q8N3E9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLCD3Q8N3E9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLCD3Q8N3E9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLCD3Q8N3E9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PLCD3Q8N3E9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLCD3Q8N3E9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLCD3Q8N3E9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLCD3Q8N3E9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PLCD3Q8N3E9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLCD3Q8N3E9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLCD3Q8N3E9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLCD3Q8N3E9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLCD3Q8N3E9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLCD3Q8N3E9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PLCD3Q8N3E9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLCD3Q8N3E9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLCD3Q8N3E9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLCD3Q8N3E9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLCD3Q8N3E9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLCD3Q8N3E9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLCD3Q8N3E9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLCD3Q8N3E9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLCD3Q8N3E9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLCD3Q8N3E9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLCD3Q8N3E9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLCD3Q8N3E9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLCD3Q8N3E9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLCD3Q8N3E9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLCD3Q8N3E9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLCD3Q8N3E9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLCD3Q8N3E9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLCD3Q8N3E9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLCD3Q8N3E9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLCD3Q8N3E9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLCD3Q8N3E9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLCD3Q8N3E9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLCD3Q8N3E9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLCD3Q8N3E9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLCD3Q8N3E9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLCD3Q8N3E9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLCD3Q8N3E9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLCD3Q8N3E9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLCD3Q8N3E9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLCD3Q8N3E9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PLCD3Q8N3E9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLCD3Q8N3E9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLCD3Q8N3E9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLCD3Q8N3E9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLCD3Q8N3E9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLCD3Q8N3E9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLCD3Q8N3E9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLCD3Q8N3E9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PLCD3Q8N3E9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLCD3Q8N3E9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLCD3Q8N3E9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLCD3Q8N3E9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLCD3Q8N3E9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLCD3Q8N3E9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms