Protein–RNA interactions for Protein: Q8N114

SHISA5, Protein shisa-5, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA5Q8N114 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHISA5Q8N114 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHISA5Q8N114 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SHISA5Q8N114 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SHISA5Q8N114 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHISA5Q8N114 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHISA5Q8N114 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHISA5Q8N114 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHISA5Q8N114 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHISA5Q8N114 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHISA5Q8N114 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SHISA5Q8N114 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHISA5Q8N114 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHISA5Q8N114 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHISA5Q8N114 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHISA5Q8N114 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHISA5Q8N114 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHISA5Q8N114 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHISA5Q8N114 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHISA5Q8N114 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHISA5Q8N114 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHISA5Q8N114 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHISA5Q8N114 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHISA5Q8N114 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHISA5Q8N114 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHISA5Q8N114 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHISA5Q8N114 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHISA5Q8N114 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHISA5Q8N114 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHISA5Q8N114 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHISA5Q8N114 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SHISA5Q8N114 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SHISA5Q8N114 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHISA5Q8N114 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHISA5Q8N114 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHISA5Q8N114 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHISA5Q8N114 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHISA5Q8N114 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHISA5Q8N114 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHISA5Q8N114 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHISA5Q8N114 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHISA5Q8N114 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHISA5Q8N114 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHISA5Q8N114 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHISA5Q8N114 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHISA5Q8N114 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHISA5Q8N114 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHISA5Q8N114 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHISA5Q8N114 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHISA5Q8N114 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHISA5Q8N114 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SHISA5Q8N114 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHISA5Q8N114 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHISA5Q8N114 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHISA5Q8N114 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHISA5Q8N114 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SHISA5Q8N114 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SHISA5Q8N114 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHISA5Q8N114 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHISA5Q8N114 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHISA5Q8N114 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHISA5Q8N114 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHISA5Q8N114 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHISA5Q8N114 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHISA5Q8N114 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHISA5Q8N114 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHISA5Q8N114 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHISA5Q8N114 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHISA5Q8N114 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHISA5Q8N114 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHISA5Q8N114 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHISA5Q8N114 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHISA5Q8N114 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHISA5Q8N114 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHISA5Q8N114 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHISA5Q8N114 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHISA5Q8N114 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHISA5Q8N114 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHISA5Q8N114 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SHISA5Q8N114 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHISA5Q8N114 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHISA5Q8N114 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHISA5Q8N114 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHISA5Q8N114 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHISA5Q8N114 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHISA5Q8N114 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SHISA5Q8N114 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHISA5Q8N114 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SHISA5Q8N114 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHISA5Q8N114 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHISA5Q8N114 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHISA5Q8N114 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHISA5Q8N114 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHISA5Q8N114 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHISA5Q8N114 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHISA5Q8N114 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SHISA5Q8N114 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHISA5Q8N114 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHISA5Q8N114 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHISA5Q8N114 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms