Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC103Q8IW40 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC103Q8IW40 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC103Q8IW40 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC103Q8IW40 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC103Q8IW40 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC103Q8IW40 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC103Q8IW40 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC103Q8IW40 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC103Q8IW40 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC103Q8IW40 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC103Q8IW40 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC103Q8IW40 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC103Q8IW40 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC103Q8IW40 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC103Q8IW40 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC103Q8IW40 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC103Q8IW40 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC103Q8IW40 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC103Q8IW40 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC103Q8IW40 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC103Q8IW40 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC103Q8IW40 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC103Q8IW40 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC103Q8IW40 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC103Q8IW40 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC103Q8IW40 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC103Q8IW40 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC103Q8IW40 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC103Q8IW40 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC103Q8IW40 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC103Q8IW40 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC103Q8IW40 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC103Q8IW40 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC103Q8IW40 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC103Q8IW40 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC103Q8IW40 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC103Q8IW40 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC103Q8IW40 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC103Q8IW40 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC103Q8IW40 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC103Q8IW40 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC103Q8IW40 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC103Q8IW40 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC103Q8IW40 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC103Q8IW40 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC103Q8IW40 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC103Q8IW40 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC103Q8IW40 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC103Q8IW40 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC103Q8IW40 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC103Q8IW40 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC103Q8IW40 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC103Q8IW40 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC103Q8IW40 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC103Q8IW40 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC103Q8IW40 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC103Q8IW40 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC103Q8IW40 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC103Q8IW40 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC103Q8IW40 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC103Q8IW40 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC103Q8IW40 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC103Q8IW40 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC103Q8IW40 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC103Q8IW40 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC103Q8IW40 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC103Q8IW40 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC103Q8IW40 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC103Q8IW40 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC103Q8IW40 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC103Q8IW40 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC103Q8IW40 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC103Q8IW40 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC103Q8IW40 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC103Q8IW40 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC103Q8IW40 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC103Q8IW40 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC103Q8IW40 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC103Q8IW40 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC103Q8IW40 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC103Q8IW40 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms