Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CD163Q86VB7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD163Q86VB7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD163Q86VB7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD163Q86VB7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD163Q86VB7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD163Q86VB7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD163Q86VB7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD163Q86VB7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD163Q86VB7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD163Q86VB7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD163Q86VB7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD163Q86VB7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD163Q86VB7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD163Q86VB7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD163Q86VB7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD163Q86VB7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD163Q86VB7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD163Q86VB7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD163Q86VB7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD163Q86VB7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD163Q86VB7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD163Q86VB7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD163Q86VB7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD163Q86VB7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD163Q86VB7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD163Q86VB7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD163Q86VB7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CD163Q86VB7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD163Q86VB7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD163Q86VB7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD163Q86VB7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD163Q86VB7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD163Q86VB7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD163Q86VB7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD163Q86VB7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD163Q86VB7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD163Q86VB7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD163Q86VB7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD163Q86VB7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD163Q86VB7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD163Q86VB7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CD163Q86VB7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CD163Q86VB7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD163Q86VB7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD163Q86VB7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD163Q86VB7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD163Q86VB7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD163Q86VB7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD163Q86VB7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD163Q86VB7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD163Q86VB7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD163Q86VB7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD163Q86VB7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD163Q86VB7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD163Q86VB7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD163Q86VB7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD163Q86VB7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD163Q86VB7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD163Q86VB7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD163Q86VB7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD163Q86VB7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD163Q86VB7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CD163Q86VB7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD163Q86VB7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD163Q86VB7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD163Q86VB7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD163Q86VB7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD163Q86VB7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CD163Q86VB7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD163Q86VB7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD163Q86VB7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD163Q86VB7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD163Q86VB7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD163Q86VB7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD163Q86VB7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD163Q86VB7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD163Q86VB7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CD163Q86VB7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CD163Q86VB7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CD163Q86VB7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD163Q86VB7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD163Q86VB7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD163Q86VB7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CD163Q86VB7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD163Q86VB7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD163Q86VB7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD163Q86VB7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD163Q86VB7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD163Q86VB7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD163Q86VB7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD163Q86VB7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD163Q86VB7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD163Q86VB7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD163Q86VB7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD163Q86VB7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD163Q86VB7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CD163Q86VB7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD163Q86VB7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD163Q86VB7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms