Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW1

SLC51A, Organic solute transporter subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC51AQ86UW1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC51AQ86UW1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC51AQ86UW1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC51AQ86UW1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC51AQ86UW1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC51AQ86UW1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC51AQ86UW1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC51AQ86UW1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC51AQ86UW1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC51AQ86UW1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC51AQ86UW1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC51AQ86UW1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC51AQ86UW1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC51AQ86UW1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC51AQ86UW1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC51AQ86UW1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC51AQ86UW1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC51AQ86UW1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC51AQ86UW1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC51AQ86UW1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC51AQ86UW1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC51AQ86UW1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC51AQ86UW1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC51AQ86UW1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC51AQ86UW1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC51AQ86UW1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC51AQ86UW1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC51AQ86UW1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC51AQ86UW1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC51AQ86UW1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC51AQ86UW1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC51AQ86UW1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC51AQ86UW1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC51AQ86UW1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC51AQ86UW1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC51AQ86UW1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC51AQ86UW1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC51AQ86UW1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC51AQ86UW1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC51AQ86UW1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC51AQ86UW1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC51AQ86UW1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC51AQ86UW1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC51AQ86UW1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC51AQ86UW1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC51AQ86UW1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC51AQ86UW1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC51AQ86UW1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC51AQ86UW1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC51AQ86UW1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC51AQ86UW1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC51AQ86UW1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC51AQ86UW1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC51AQ86UW1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC51AQ86UW1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC51AQ86UW1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC51AQ86UW1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC51AQ86UW1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC51AQ86UW1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC51AQ86UW1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC51AQ86UW1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC51AQ86UW1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC51AQ86UW1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC51AQ86UW1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC51AQ86UW1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC51AQ86UW1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC51AQ86UW1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC51AQ86UW1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC51AQ86UW1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC51AQ86UW1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC51AQ86UW1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC51AQ86UW1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC51AQ86UW1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC51AQ86UW1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC51AQ86UW1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC51AQ86UW1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC51AQ86UW1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC51AQ86UW1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC51AQ86UW1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC51AQ86UW1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC51AQ86UW1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC51AQ86UW1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC51AQ86UW1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC51AQ86UW1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC51AQ86UW1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC51AQ86UW1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC51AQ86UW1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC51AQ86UW1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC51AQ86UW1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC51AQ86UW1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC51AQ86UW1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC51AQ86UW1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC51AQ86UW1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC51AQ86UW1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC51AQ86UW1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC51AQ86UW1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC51AQ86UW1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC51AQ86UW1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC51AQ86UW1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC51AQ86UW1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.6 ms