Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5M5

TMC3, Transmembrane channel-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3Q7Z5M5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC3Q7Z5M5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC3Q7Z5M5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC3Q7Z5M5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC3Q7Z5M5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC3Q7Z5M5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC3Q7Z5M5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC3Q7Z5M5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC3Q7Z5M5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC3Q7Z5M5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC3Q7Z5M5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC3Q7Z5M5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC3Q7Z5M5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC3Q7Z5M5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC3Q7Z5M5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC3Q7Z5M5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMC3Q7Z5M5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TMC3Q7Z5M5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMC3Q7Z5M5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMC3Q7Z5M5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMC3Q7Z5M5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMC3Q7Z5M5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMC3Q7Z5M5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMC3Q7Z5M5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMC3Q7Z5M5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMC3Q7Z5M5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMC3Q7Z5M5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMC3Q7Z5M5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMC3Q7Z5M5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMC3Q7Z5M5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMC3Q7Z5M5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMC3Q7Z5M5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMC3Q7Z5M5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMC3Q7Z5M5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMC3Q7Z5M5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMC3Q7Z5M5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMC3Q7Z5M5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMC3Q7Z5M5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMC3Q7Z5M5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMC3Q7Z5M5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMC3Q7Z5M5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMC3Q7Z5M5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMC3Q7Z5M5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMC3Q7Z5M5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMC3Q7Z5M5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMC3Q7Z5M5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMC3Q7Z5M5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMC3Q7Z5M5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMC3Q7Z5M5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMC3Q7Z5M5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMC3Q7Z5M5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMC3Q7Z5M5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMC3Q7Z5M5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMC3Q7Z5M5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMC3Q7Z5M5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMC3Q7Z5M5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMC3Q7Z5M5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMC3Q7Z5M5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMC3Q7Z5M5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMC3Q7Z5M5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMC3Q7Z5M5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMC3Q7Z5M5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMC3Q7Z5M5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMC3Q7Z5M5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMC3Q7Z5M5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMC3Q7Z5M5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMC3Q7Z5M5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMC3Q7Z5M5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMC3Q7Z5M5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMC3Q7Z5M5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMC3Q7Z5M5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TMC3Q7Z5M5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMC3Q7Z5M5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMC3Q7Z5M5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMC3Q7Z5M5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMC3Q7Z5M5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMC3Q7Z5M5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMC3Q7Z5M5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMC3Q7Z5M5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMC3Q7Z5M5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMC3Q7Z5M5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TMC3Q7Z5M5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMC3Q7Z5M5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMC3Q7Z5M5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMC3Q7Z5M5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMC3Q7Z5M5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMC3Q7Z5M5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMC3Q7Z5M5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMC3Q7Z5M5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMC3Q7Z5M5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMC3Q7Z5M5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMC3Q7Z5M5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMC3Q7Z5M5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMC3Q7Z5M5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMC3Q7Z5M5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMC3Q7Z5M5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMC3Q7Z5M5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMC3Q7Z5M5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMC3Q7Z5M5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMC3Q7Z5M5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms