Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR2

NLRC3, NLR family CARD domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3Q7RTR2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRC3Q7RTR2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRC3Q7RTR2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRC3Q7RTR2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRC3Q7RTR2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRC3Q7RTR2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRC3Q7RTR2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRC3Q7RTR2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRC3Q7RTR2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRC3Q7RTR2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRC3Q7RTR2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
NLRC3Q7RTR2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRC3Q7RTR2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRC3Q7RTR2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRC3Q7RTR2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRC3Q7RTR2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRC3Q7RTR2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRC3Q7RTR2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRC3Q7RTR2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRC3Q7RTR2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRC3Q7RTR2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRC3Q7RTR2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRC3Q7RTR2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRC3Q7RTR2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRC3Q7RTR2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRC3Q7RTR2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRC3Q7RTR2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRC3Q7RTR2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRC3Q7RTR2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRC3Q7RTR2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRC3Q7RTR2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRC3Q7RTR2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRC3Q7RTR2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRC3Q7RTR2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRC3Q7RTR2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRC3Q7RTR2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRC3Q7RTR2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NLRC3Q7RTR2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NLRC3Q7RTR2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NLRC3Q7RTR2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NLRC3Q7RTR2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NLRC3Q7RTR2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NLRC3Q7RTR2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NLRC3Q7RTR2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NLRC3Q7RTR2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NLRC3Q7RTR2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NLRC3Q7RTR2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NLRC3Q7RTR2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NLRC3Q7RTR2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NLRC3Q7RTR2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NLRC3Q7RTR2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NLRC3Q7RTR2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NLRC3Q7RTR2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NLRC3Q7RTR2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NLRC3Q7RTR2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NLRC3Q7RTR2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NLRC3Q7RTR2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NLRC3Q7RTR2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NLRC3Q7RTR2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NLRC3Q7RTR2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NLRC3Q7RTR2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NLRC3Q7RTR2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NLRC3Q7RTR2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NLRC3Q7RTR2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NLRC3Q7RTR2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NLRC3Q7RTR2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NLRC3Q7RTR2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NLRC3Q7RTR2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NLRC3Q7RTR2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRC3Q7RTR2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms