Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5N7

LPCAT2, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT2Q7L5N7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LPCAT2Q7L5N7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LPCAT2Q7L5N7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LPCAT2Q7L5N7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LPCAT2Q7L5N7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LPCAT2Q7L5N7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LPCAT2Q7L5N7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LPCAT2Q7L5N7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LPCAT2Q7L5N7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LPCAT2Q7L5N7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LPCAT2Q7L5N7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LPCAT2Q7L5N7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LPCAT2Q7L5N7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LPCAT2Q7L5N7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LPCAT2Q7L5N7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LPCAT2Q7L5N7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LPCAT2Q7L5N7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LPCAT2Q7L5N7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LPCAT2Q7L5N7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LPCAT2Q7L5N7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LPCAT2Q7L5N7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LPCAT2Q7L5N7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LPCAT2Q7L5N7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LPCAT2Q7L5N7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LPCAT2Q7L5N7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LPCAT2Q7L5N7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LPCAT2Q7L5N7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LPCAT2Q7L5N7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LPCAT2Q7L5N7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LPCAT2Q7L5N7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LPCAT2Q7L5N7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LPCAT2Q7L5N7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LPCAT2Q7L5N7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LPCAT2Q7L5N7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LPCAT2Q7L5N7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LPCAT2Q7L5N7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LPCAT2Q7L5N7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LPCAT2Q7L5N7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LPCAT2Q7L5N7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LPCAT2Q7L5N7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LPCAT2Q7L5N7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LPCAT2Q7L5N7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LPCAT2Q7L5N7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LPCAT2Q7L5N7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LPCAT2Q7L5N7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LPCAT2Q7L5N7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LPCAT2Q7L5N7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LPCAT2Q7L5N7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LPCAT2Q7L5N7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LPCAT2Q7L5N7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LPCAT2Q7L5N7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LPCAT2Q7L5N7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
LPCAT2Q7L5N7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LPCAT2Q7L5N7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LPCAT2Q7L5N7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LPCAT2Q7L5N7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LPCAT2Q7L5N7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LPCAT2Q7L5N7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LPCAT2Q7L5N7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LPCAT2Q7L5N7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LPCAT2Q7L5N7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LPCAT2Q7L5N7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LPCAT2Q7L5N7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LPCAT2Q7L5N7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LPCAT2Q7L5N7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LPCAT2Q7L5N7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LPCAT2Q7L5N7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LPCAT2Q7L5N7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LPCAT2Q7L5N7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LPCAT2Q7L5N7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LPCAT2Q7L5N7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LPCAT2Q7L5N7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LPCAT2Q7L5N7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LPCAT2Q7L5N7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LPCAT2Q7L5N7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LPCAT2Q7L5N7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LPCAT2Q7L5N7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LPCAT2Q7L5N7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LPCAT2Q7L5N7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LPCAT2Q7L5N7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LPCAT2Q7L5N7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LPCAT2Q7L5N7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LPCAT2Q7L5N7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LPCAT2Q7L5N7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LPCAT2Q7L5N7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LPCAT2Q7L5N7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LPCAT2Q7L5N7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LPCAT2Q7L5N7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LPCAT2Q7L5N7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LPCAT2Q7L5N7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LPCAT2Q7L5N7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LPCAT2Q7L5N7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LPCAT2Q7L5N7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LPCAT2Q7L5N7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LPCAT2Q7L5N7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LPCAT2Q7L5N7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LPCAT2Q7L5N7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LPCAT2Q7L5N7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LPCAT2Q7L5N7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LPCAT2Q7L5N7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms