Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PREX2Q70Z35 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PREX2Q70Z35 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
PREX2Q70Z35 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
PREX2Q70Z35 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
PREX2Q70Z35 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
PREX2Q70Z35 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
PREX2Q70Z35 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
PREX2Q70Z35 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PREX2Q70Z35 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PREX2Q70Z35 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PREX2Q70Z35 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PREX2Q70Z35 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PREX2Q70Z35 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PREX2Q70Z35 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PREX2Q70Z35 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
PREX2Q70Z35 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PREX2Q70Z35 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
PREX2Q70Z35 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
PREX2Q70Z35 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
PREX2Q70Z35 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PREX2Q70Z35 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PREX2Q70Z35 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PREX2Q70Z35 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PREX2Q70Z35 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PREX2Q70Z35 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PREX2Q70Z35 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
PREX2Q70Z35 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PREX2Q70Z35 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PREX2Q70Z35 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PREX2Q70Z35 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
PREX2Q70Z35 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
PREX2Q70Z35 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
PREX2Q70Z35 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
PREX2Q70Z35 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PREX2Q70Z35 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PREX2Q70Z35 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC36.35■■■■□ 3.41
PREX2Q70Z35 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PREX2Q70Z35 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PREX2Q70Z35 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PREX2Q70Z35 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PREX2Q70Z35 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PREX2Q70Z35 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PREX2Q70Z35 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
PREX2Q70Z35 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
PREX2Q70Z35 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
PREX2Q70Z35 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
PREX2Q70Z35 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
PREX2Q70Z35 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
PREX2Q70Z35 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
PREX2Q70Z35 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
PREX2Q70Z35 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
PREX2Q70Z35 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PREX2Q70Z35 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PREX2Q70Z35 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PREX2Q70Z35 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PREX2Q70Z35 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PREX2Q70Z35 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PREX2Q70Z35 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PREX2Q70Z35 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PREX2Q70Z35 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PREX2Q70Z35 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PREX2Q70Z35 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PREX2Q70Z35 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PREX2Q70Z35 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PREX2Q70Z35 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
PREX2Q70Z35 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PREX2Q70Z35 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PREX2Q70Z35 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PREX2Q70Z35 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PREX2Q70Z35 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
PREX2Q70Z35 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
PREX2Q70Z35 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
PREX2Q70Z35 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
PREX2Q70Z35 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
PREX2Q70Z35 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.39
PREX2Q70Z35 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
PREX2Q70Z35 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
PREX2Q70Z35 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PREX2Q70Z35 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PREX2Q70Z35 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PREX2Q70Z35 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
PREX2Q70Z35 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PREX2Q70Z35 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
PREX2Q70Z35 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PREX2Q70Z35 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PREX2Q70Z35 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PREX2Q70Z35 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PREX2Q70Z35 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PREX2Q70Z35 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PREX2Q70Z35 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PREX2Q70Z35 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PREX2Q70Z35 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PREX2Q70Z35 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PREX2Q70Z35 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PREX2Q70Z35 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PREX2Q70Z35 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PREX2Q70Z35 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PREX2Q70Z35 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
PREX2Q70Z35 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms