Protein–RNA interactions for Protein: Q70JA7

CHSY3, Chondroitin sulfate synthase 3, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY3Q70JA7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHSY3Q70JA7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHSY3Q70JA7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHSY3Q70JA7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CHSY3Q70JA7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHSY3Q70JA7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHSY3Q70JA7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHSY3Q70JA7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHSY3Q70JA7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHSY3Q70JA7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHSY3Q70JA7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHSY3Q70JA7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHSY3Q70JA7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHSY3Q70JA7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHSY3Q70JA7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHSY3Q70JA7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHSY3Q70JA7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHSY3Q70JA7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHSY3Q70JA7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHSY3Q70JA7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHSY3Q70JA7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHSY3Q70JA7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHSY3Q70JA7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHSY3Q70JA7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHSY3Q70JA7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CHSY3Q70JA7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHSY3Q70JA7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHSY3Q70JA7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHSY3Q70JA7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHSY3Q70JA7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHSY3Q70JA7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHSY3Q70JA7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHSY3Q70JA7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHSY3Q70JA7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHSY3Q70JA7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHSY3Q70JA7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHSY3Q70JA7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHSY3Q70JA7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CHSY3Q70JA7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHSY3Q70JA7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHSY3Q70JA7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHSY3Q70JA7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHSY3Q70JA7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHSY3Q70JA7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHSY3Q70JA7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHSY3Q70JA7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHSY3Q70JA7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHSY3Q70JA7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHSY3Q70JA7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHSY3Q70JA7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHSY3Q70JA7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHSY3Q70JA7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHSY3Q70JA7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHSY3Q70JA7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CHSY3Q70JA7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHSY3Q70JA7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHSY3Q70JA7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHSY3Q70JA7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHSY3Q70JA7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHSY3Q70JA7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHSY3Q70JA7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHSY3Q70JA7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHSY3Q70JA7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHSY3Q70JA7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHSY3Q70JA7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHSY3Q70JA7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CHSY3Q70JA7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CHSY3Q70JA7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHSY3Q70JA7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHSY3Q70JA7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHSY3Q70JA7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHSY3Q70JA7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHSY3Q70JA7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHSY3Q70JA7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHSY3Q70JA7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHSY3Q70JA7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHSY3Q70JA7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHSY3Q70JA7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHSY3Q70JA7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHSY3Q70JA7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHSY3Q70JA7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHSY3Q70JA7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHSY3Q70JA7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHSY3Q70JA7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHSY3Q70JA7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHSY3Q70JA7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHSY3Q70JA7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHSY3Q70JA7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHSY3Q70JA7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHSY3Q70JA7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHSY3Q70JA7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHSY3Q70JA7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHSY3Q70JA7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHSY3Q70JA7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHSY3Q70JA7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHSY3Q70JA7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHSY3Q70JA7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHSY3Q70JA7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHSY3Q70JA7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHSY3Q70JA7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms