Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
UBR3Q6ZT12 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
UBR3Q6ZT12 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
UBR3Q6ZT12 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
UBR3Q6ZT12 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
UBR3Q6ZT12 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
UBR3Q6ZT12 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
UBR3Q6ZT12 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
UBR3Q6ZT12 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
UBR3Q6ZT12 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
UBR3Q6ZT12 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
UBR3Q6ZT12 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
UBR3Q6ZT12 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
UBR3Q6ZT12 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC30.27■■■□□ 2.44
UBR3Q6ZT12 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
UBR3Q6ZT12 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
UBR3Q6ZT12 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
UBR3Q6ZT12 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
UBR3Q6ZT12 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
UBR3Q6ZT12 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
UBR3Q6ZT12 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
UBR3Q6ZT12 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
UBR3Q6ZT12 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
UBR3Q6ZT12 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
UBR3Q6ZT12 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
UBR3Q6ZT12 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
UBR3Q6ZT12 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
UBR3Q6ZT12 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
UBR3Q6ZT12 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
UBR3Q6ZT12 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
UBR3Q6ZT12 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
UBR3Q6ZT12 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
UBR3Q6ZT12 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
UBR3Q6ZT12 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
UBR3Q6ZT12 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
UBR3Q6ZT12 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
UBR3Q6ZT12 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
UBR3Q6ZT12 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
UBR3Q6ZT12 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
UBR3Q6ZT12 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
UBR3Q6ZT12 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
UBR3Q6ZT12 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
UBR3Q6ZT12 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
UBR3Q6ZT12 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
UBR3Q6ZT12 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
UBR3Q6ZT12 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
UBR3Q6ZT12 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
UBR3Q6ZT12 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
UBR3Q6ZT12 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
UBR3Q6ZT12 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
UBR3Q6ZT12 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
UBR3Q6ZT12 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
UBR3Q6ZT12 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
UBR3Q6ZT12 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
UBR3Q6ZT12 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
UBR3Q6ZT12 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
UBR3Q6ZT12 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
UBR3Q6ZT12 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
UBR3Q6ZT12 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
UBR3Q6ZT12 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
UBR3Q6ZT12 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
UBR3Q6ZT12 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
UBR3Q6ZT12 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
UBR3Q6ZT12 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
UBR3Q6ZT12 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
UBR3Q6ZT12 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
UBR3Q6ZT12 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
UBR3Q6ZT12 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
UBR3Q6ZT12 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
UBR3Q6ZT12 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
UBR3Q6ZT12 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
UBR3Q6ZT12 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
UBR3Q6ZT12 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
UBR3Q6ZT12 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
UBR3Q6ZT12 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
UBR3Q6ZT12 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
UBR3Q6ZT12 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
UBR3Q6ZT12 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
UBR3Q6ZT12 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
UBR3Q6ZT12 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
UBR3Q6ZT12 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
UBR3Q6ZT12 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
UBR3Q6ZT12 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
UBR3Q6ZT12 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
UBR3Q6ZT12 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
UBR3Q6ZT12 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
UBR3Q6ZT12 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
UBR3Q6ZT12 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
UBR3Q6ZT12 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
UBR3Q6ZT12 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
UBR3Q6ZT12 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
UBR3Q6ZT12 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
UBR3Q6ZT12 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
UBR3Q6ZT12 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
UBR3Q6ZT12 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
UBR3Q6ZT12 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
UBR3Q6ZT12 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
UBR3Q6ZT12 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
UBR3Q6ZT12 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
UBR3Q6ZT12 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms