Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LINC00299Q6ZSB3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LINC00299Q6ZSB3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LINC00299Q6ZSB3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LINC00299Q6ZSB3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LINC00299Q6ZSB3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LINC00299Q6ZSB3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LINC00299Q6ZSB3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
LINC00299Q6ZSB3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LINC00299Q6ZSB3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LINC00299Q6ZSB3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC00299Q6ZSB3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC00299Q6ZSB3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC00299Q6ZSB3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC00299Q6ZSB3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC00299Q6ZSB3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC00299Q6ZSB3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC00299Q6ZSB3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC00299Q6ZSB3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC00299Q6ZSB3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC00299Q6ZSB3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC00299Q6ZSB3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00299Q6ZSB3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00299Q6ZSB3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00299Q6ZSB3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00299Q6ZSB3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00299Q6ZSB3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00299Q6ZSB3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00299Q6ZSB3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LINC00299Q6ZSB3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LINC00299Q6ZSB3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LINC00299Q6ZSB3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
LINC00299Q6ZSB3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LINC00299Q6ZSB3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LINC00299Q6ZSB3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LINC00299Q6ZSB3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LINC00299Q6ZSB3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LINC00299Q6ZSB3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LINC00299Q6ZSB3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00299Q6ZSB3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00299Q6ZSB3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00299Q6ZSB3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00299Q6ZSB3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00299Q6ZSB3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00299Q6ZSB3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LINC00299Q6ZSB3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
LINC00299Q6ZSB3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LINC00299Q6ZSB3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LINC00299Q6ZSB3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LINC00299Q6ZSB3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LINC00299Q6ZSB3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LINC00299Q6ZSB3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LINC00299Q6ZSB3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LINC00299Q6ZSB3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LINC00299Q6ZSB3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LINC00299Q6ZSB3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LINC00299Q6ZSB3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LINC00299Q6ZSB3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LINC00299Q6ZSB3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LINC00299Q6ZSB3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LINC00299Q6ZSB3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LINC00299Q6ZSB3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
LINC00299Q6ZSB3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
LINC00299Q6ZSB3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
LINC00299Q6ZSB3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00299Q6ZSB3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00299Q6ZSB3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00299Q6ZSB3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00299Q6ZSB3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00299Q6ZSB3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00299Q6ZSB3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00299Q6ZSB3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00299Q6ZSB3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00299Q6ZSB3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00299Q6ZSB3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00299Q6ZSB3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00299Q6ZSB3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00299Q6ZSB3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00299Q6ZSB3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LINC00299Q6ZSB3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LINC00299Q6ZSB3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LINC00299Q6ZSB3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LINC00299Q6ZSB3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LINC00299Q6ZSB3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
LINC00299Q6ZSB3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LINC00299Q6ZSB3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LINC00299Q6ZSB3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LINC00299Q6ZSB3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LINC00299Q6ZSB3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LINC00299Q6ZSB3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LINC00299Q6ZSB3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LINC00299Q6ZSB3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LINC00299Q6ZSB3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
LINC00299Q6ZSB3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LINC00299Q6ZSB3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LINC00299Q6ZSB3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LINC00299Q6ZSB3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LINC00299Q6ZSB3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LINC00299Q6ZSB3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
LINC00299Q6ZSB3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 313.2 ms