Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms