Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL35Q6PF15 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL35Q6PF15 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms