Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDC42EP5Q6NZY7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDC42EP5Q6NZY7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDC42EP5Q6NZY7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDC42EP5Q6NZY7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CDC42EP5Q6NZY7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDC42EP5Q6NZY7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDC42EP5Q6NZY7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDC42EP5Q6NZY7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDC42EP5Q6NZY7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDC42EP5Q6NZY7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDC42EP5Q6NZY7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDC42EP5Q6NZY7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDC42EP5Q6NZY7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDC42EP5Q6NZY7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDC42EP5Q6NZY7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CDC42EP5Q6NZY7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDC42EP5Q6NZY7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDC42EP5Q6NZY7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDC42EP5Q6NZY7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDC42EP5Q6NZY7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDC42EP5Q6NZY7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CDC42EP5Q6NZY7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDC42EP5Q6NZY7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDC42EP5Q6NZY7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDC42EP5Q6NZY7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDC42EP5Q6NZY7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDC42EP5Q6NZY7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDC42EP5Q6NZY7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CDC42EP5Q6NZY7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDC42EP5Q6NZY7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDC42EP5Q6NZY7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDC42EP5Q6NZY7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDC42EP5Q6NZY7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CDC42EP5Q6NZY7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CDC42EP5Q6NZY7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDC42EP5Q6NZY7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDC42EP5Q6NZY7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDC42EP5Q6NZY7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDC42EP5Q6NZY7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDC42EP5Q6NZY7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDC42EP5Q6NZY7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDC42EP5Q6NZY7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDC42EP5Q6NZY7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDC42EP5Q6NZY7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDC42EP5Q6NZY7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDC42EP5Q6NZY7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDC42EP5Q6NZY7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDC42EP5Q6NZY7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDC42EP5Q6NZY7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDC42EP5Q6NZY7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDC42EP5Q6NZY7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDC42EP5Q6NZY7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDC42EP5Q6NZY7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDC42EP5Q6NZY7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDC42EP5Q6NZY7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDC42EP5Q6NZY7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDC42EP5Q6NZY7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDC42EP5Q6NZY7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CDC42EP5Q6NZY7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDC42EP5Q6NZY7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDC42EP5Q6NZY7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDC42EP5Q6NZY7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDC42EP5Q6NZY7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CDC42EP5Q6NZY7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDC42EP5Q6NZY7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDC42EP5Q6NZY7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDC42EP5Q6NZY7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CDC42EP5Q6NZY7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CDC42EP5Q6NZY7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CDC42EP5Q6NZY7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDC42EP5Q6NZY7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDC42EP5Q6NZY7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDC42EP5Q6NZY7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CDC42EP5Q6NZY7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDC42EP5Q6NZY7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDC42EP5Q6NZY7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDC42EP5Q6NZY7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDC42EP5Q6NZY7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDC42EP5Q6NZY7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDC42EP5Q6NZY7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CDC42EP5Q6NZY7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CDC42EP5Q6NZY7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CDC42EP5Q6NZY7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CDC42EP5Q6NZY7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDC42EP5Q6NZY7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDC42EP5Q6NZY7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CDC42EP5Q6NZY7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDC42EP5Q6NZY7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDC42EP5Q6NZY7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDC42EP5Q6NZY7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDC42EP5Q6NZY7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDC42EP5Q6NZY7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDC42EP5Q6NZY7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDC42EP5Q6NZY7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDC42EP5Q6NZY7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDC42EP5Q6NZY7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms