Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUM9

RETSAT, All-trans-retinol 13,14-reductase, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETSATQ6NUM9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RETSATQ6NUM9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RETSATQ6NUM9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RETSATQ6NUM9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RETSATQ6NUM9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RETSATQ6NUM9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RETSATQ6NUM9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RETSATQ6NUM9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RETSATQ6NUM9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RETSATQ6NUM9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RETSATQ6NUM9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RETSATQ6NUM9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RETSATQ6NUM9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RETSATQ6NUM9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RETSATQ6NUM9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RETSATQ6NUM9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RETSATQ6NUM9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RETSATQ6NUM9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RETSATQ6NUM9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RETSATQ6NUM9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RETSATQ6NUM9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RETSATQ6NUM9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RETSATQ6NUM9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RETSATQ6NUM9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RETSATQ6NUM9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RETSATQ6NUM9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RETSATQ6NUM9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RETSATQ6NUM9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RETSATQ6NUM9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RETSATQ6NUM9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RETSATQ6NUM9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RETSATQ6NUM9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RETSATQ6NUM9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RETSATQ6NUM9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RETSATQ6NUM9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RETSATQ6NUM9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RETSATQ6NUM9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
RETSATQ6NUM9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
RETSATQ6NUM9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RETSATQ6NUM9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RETSATQ6NUM9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RETSATQ6NUM9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RETSATQ6NUM9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RETSATQ6NUM9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RETSATQ6NUM9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RETSATQ6NUM9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RETSATQ6NUM9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RETSATQ6NUM9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RETSATQ6NUM9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RETSATQ6NUM9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RETSATQ6NUM9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RETSATQ6NUM9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RETSATQ6NUM9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RETSATQ6NUM9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RETSATQ6NUM9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RETSATQ6NUM9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RETSATQ6NUM9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RETSATQ6NUM9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RETSATQ6NUM9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RETSATQ6NUM9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RETSATQ6NUM9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RETSATQ6NUM9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RETSATQ6NUM9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RETSATQ6NUM9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RETSATQ6NUM9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RETSATQ6NUM9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RETSATQ6NUM9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RETSATQ6NUM9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RETSATQ6NUM9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RETSATQ6NUM9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RETSATQ6NUM9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RETSATQ6NUM9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RETSATQ6NUM9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RETSATQ6NUM9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RETSATQ6NUM9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RETSATQ6NUM9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RETSATQ6NUM9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RETSATQ6NUM9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RETSATQ6NUM9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RETSATQ6NUM9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RETSATQ6NUM9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RETSATQ6NUM9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RETSATQ6NUM9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RETSATQ6NUM9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RETSATQ6NUM9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RETSATQ6NUM9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RETSATQ6NUM9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RETSATQ6NUM9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RETSATQ6NUM9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RETSATQ6NUM9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RETSATQ6NUM9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RETSATQ6NUM9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RETSATQ6NUM9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RETSATQ6NUM9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RETSATQ6NUM9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RETSATQ6NUM9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RETSATQ6NUM9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RETSATQ6NUM9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RETSATQ6NUM9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RETSATQ6NUM9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms