Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MCTP1Q6DN14 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MCTP1Q6DN14 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MCTP1Q6DN14 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MCTP1Q6DN14 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MCTP1Q6DN14 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MCTP1Q6DN14 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MCTP1Q6DN14 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
MCTP1Q6DN14 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MCTP1Q6DN14 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MCTP1Q6DN14 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MCTP1Q6DN14 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MCTP1Q6DN14 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MCTP1Q6DN14 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MCTP1Q6DN14 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MCTP1Q6DN14 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MCTP1Q6DN14 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MCTP1Q6DN14 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MCTP1Q6DN14 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MCTP1Q6DN14 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MCTP1Q6DN14 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MCTP1Q6DN14 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MCTP1Q6DN14 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MCTP1Q6DN14 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MCTP1Q6DN14 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MCTP1Q6DN14 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
MCTP1Q6DN14 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MCTP1Q6DN14 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MCTP1Q6DN14 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MCTP1Q6DN14 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MCTP1Q6DN14 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MCTP1Q6DN14 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MCTP1Q6DN14 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MCTP1Q6DN14 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MCTP1Q6DN14 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MCTP1Q6DN14 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MCTP1Q6DN14 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MCTP1Q6DN14 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MCTP1Q6DN14 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MCTP1Q6DN14 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MCTP1Q6DN14 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MCTP1Q6DN14 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MCTP1Q6DN14 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MCTP1Q6DN14 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCTP1Q6DN14 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCTP1Q6DN14 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCTP1Q6DN14 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCTP1Q6DN14 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCTP1Q6DN14 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCTP1Q6DN14 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCTP1Q6DN14 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
MCTP1Q6DN14 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCTP1Q6DN14 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
MCTP1Q6DN14 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCTP1Q6DN14 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCTP1Q6DN14 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCTP1Q6DN14 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MCTP1Q6DN14 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MCTP1Q6DN14 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
MCTP1Q6DN14 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MCTP1Q6DN14 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
MCTP1Q6DN14 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MCTP1Q6DN14 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MCTP1Q6DN14 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MCTP1Q6DN14 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MCTP1Q6DN14 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MCTP1Q6DN14 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MCTP1Q6DN14 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MCTP1Q6DN14 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MCTP1Q6DN14 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MCTP1Q6DN14 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MCTP1Q6DN14 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MCTP1Q6DN14 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MCTP1Q6DN14 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MCTP1Q6DN14 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MCTP1Q6DN14 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MCTP1Q6DN14 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MCTP1Q6DN14 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MCTP1Q6DN14 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MCTP1Q6DN14 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MCTP1Q6DN14 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MCTP1Q6DN14 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MCTP1Q6DN14 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MCTP1Q6DN14 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
MCTP1Q6DN14 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
MCTP1Q6DN14 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MCTP1Q6DN14 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MCTP1Q6DN14 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MCTP1Q6DN14 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MCTP1Q6DN14 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MCTP1Q6DN14 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MCTP1Q6DN14 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
MCTP1Q6DN14 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCTP1Q6DN14 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCTP1Q6DN14 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCTP1Q6DN14 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MCTP1Q6DN14 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MCTP1Q6DN14 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MCTP1Q6DN14 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MCTP1Q6DN14 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms