Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZZ1

TRIM68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM68Q6AZZ1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM68Q6AZZ1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM68Q6AZZ1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM68Q6AZZ1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM68Q6AZZ1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM68Q6AZZ1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM68Q6AZZ1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM68Q6AZZ1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM68Q6AZZ1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM68Q6AZZ1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM68Q6AZZ1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM68Q6AZZ1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM68Q6AZZ1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM68Q6AZZ1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM68Q6AZZ1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM68Q6AZZ1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM68Q6AZZ1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM68Q6AZZ1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM68Q6AZZ1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM68Q6AZZ1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM68Q6AZZ1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM68Q6AZZ1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM68Q6AZZ1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM68Q6AZZ1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM68Q6AZZ1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM68Q6AZZ1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM68Q6AZZ1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM68Q6AZZ1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM68Q6AZZ1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM68Q6AZZ1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM68Q6AZZ1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM68Q6AZZ1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM68Q6AZZ1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM68Q6AZZ1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM68Q6AZZ1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM68Q6AZZ1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM68Q6AZZ1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM68Q6AZZ1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM68Q6AZZ1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM68Q6AZZ1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM68Q6AZZ1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM68Q6AZZ1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM68Q6AZZ1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM68Q6AZZ1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM68Q6AZZ1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIM68Q6AZZ1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM68Q6AZZ1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM68Q6AZZ1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM68Q6AZZ1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM68Q6AZZ1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM68Q6AZZ1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM68Q6AZZ1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM68Q6AZZ1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM68Q6AZZ1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM68Q6AZZ1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM68Q6AZZ1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM68Q6AZZ1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM68Q6AZZ1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM68Q6AZZ1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM68Q6AZZ1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM68Q6AZZ1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM68Q6AZZ1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM68Q6AZZ1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM68Q6AZZ1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM68Q6AZZ1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM68Q6AZZ1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM68Q6AZZ1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM68Q6AZZ1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM68Q6AZZ1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM68Q6AZZ1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM68Q6AZZ1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM68Q6AZZ1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM68Q6AZZ1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM68Q6AZZ1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM68Q6AZZ1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM68Q6AZZ1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM68Q6AZZ1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM68Q6AZZ1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM68Q6AZZ1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM68Q6AZZ1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM68Q6AZZ1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM68Q6AZZ1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM68Q6AZZ1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM68Q6AZZ1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM68Q6AZZ1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM68Q6AZZ1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM68Q6AZZ1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM68Q6AZZ1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM68Q6AZZ1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM68Q6AZZ1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM68Q6AZZ1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM68Q6AZZ1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM68Q6AZZ1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM68Q6AZZ1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM68Q6AZZ1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM68Q6AZZ1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM68Q6AZZ1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM68Q6AZZ1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM68Q6AZZ1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM68Q6AZZ1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms