Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ECM29Q5VYK3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ECM29Q5VYK3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ECM29Q5VYK3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ECM29Q5VYK3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ECM29Q5VYK3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ECM29Q5VYK3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ECM29Q5VYK3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ECM29Q5VYK3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ECM29Q5VYK3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ECM29Q5VYK3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
ECM29Q5VYK3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ECM29Q5VYK3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ECM29Q5VYK3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ECM29Q5VYK3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ECM29Q5VYK3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
ECM29Q5VYK3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ECM29Q5VYK3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ECM29Q5VYK3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ECM29Q5VYK3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ECM29Q5VYK3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ECM29Q5VYK3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ECM29Q5VYK3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ECM29Q5VYK3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ECM29Q5VYK3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ECM29Q5VYK3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ECM29Q5VYK3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ECM29Q5VYK3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ECM29Q5VYK3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ECM29Q5VYK3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ECM29Q5VYK3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ECM29Q5VYK3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ECM29Q5VYK3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ECM29Q5VYK3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ECM29Q5VYK3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ECM29Q5VYK3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ECM29Q5VYK3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ECM29Q5VYK3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ECM29Q5VYK3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ECM29Q5VYK3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ECM29Q5VYK3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ECM29Q5VYK3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ECM29Q5VYK3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ECM29Q5VYK3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ECM29Q5VYK3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ECM29Q5VYK3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ECM29Q5VYK3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ECM29Q5VYK3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ECM29Q5VYK3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ECM29Q5VYK3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ECM29Q5VYK3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ECM29Q5VYK3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ECM29Q5VYK3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ECM29Q5VYK3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
ECM29Q5VYK3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ECM29Q5VYK3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ECM29Q5VYK3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ECM29Q5VYK3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ECM29Q5VYK3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ECM29Q5VYK3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ECM29Q5VYK3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ECM29Q5VYK3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ECM29Q5VYK3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ECM29Q5VYK3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ECM29Q5VYK3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ECM29Q5VYK3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ECM29Q5VYK3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ECM29Q5VYK3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ECM29Q5VYK3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ECM29Q5VYK3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ECM29Q5VYK3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ECM29Q5VYK3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ECM29Q5VYK3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ECM29Q5VYK3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ECM29Q5VYK3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ECM29Q5VYK3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ECM29Q5VYK3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ECM29Q5VYK3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ECM29Q5VYK3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ECM29Q5VYK3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ECM29Q5VYK3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ECM29Q5VYK3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ECM29Q5VYK3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ECM29Q5VYK3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ECM29Q5VYK3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ECM29Q5VYK3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ECM29Q5VYK3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ECM29Q5VYK3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ECM29Q5VYK3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ECM29Q5VYK3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ECM29Q5VYK3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ECM29Q5VYK3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ECM29Q5VYK3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ECM29Q5VYK3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ECM29Q5VYK3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ECM29Q5VYK3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ECM29Q5VYK3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ECM29Q5VYK3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ECM29Q5VYK3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ECM29Q5VYK3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms