Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms