Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRCH2Q5VUJ6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRCH2Q5VUJ6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRCH2Q5VUJ6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRCH2Q5VUJ6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRCH2Q5VUJ6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRCH2Q5VUJ6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRCH2Q5VUJ6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRCH2Q5VUJ6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRCH2Q5VUJ6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRCH2Q5VUJ6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRCH2Q5VUJ6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRCH2Q5VUJ6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRCH2Q5VUJ6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRCH2Q5VUJ6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRCH2Q5VUJ6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
LRCH2Q5VUJ6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRCH2Q5VUJ6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRCH2Q5VUJ6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRCH2Q5VUJ6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRCH2Q5VUJ6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRCH2Q5VUJ6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRCH2Q5VUJ6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRCH2Q5VUJ6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRCH2Q5VUJ6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRCH2Q5VUJ6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRCH2Q5VUJ6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
LRCH2Q5VUJ6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LRCH2Q5VUJ6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRCH2Q5VUJ6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRCH2Q5VUJ6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRCH2Q5VUJ6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRCH2Q5VUJ6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRCH2Q5VUJ6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRCH2Q5VUJ6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LRCH2Q5VUJ6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRCH2Q5VUJ6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRCH2Q5VUJ6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRCH2Q5VUJ6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRCH2Q5VUJ6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRCH2Q5VUJ6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRCH2Q5VUJ6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
LRCH2Q5VUJ6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRCH2Q5VUJ6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRCH2Q5VUJ6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRCH2Q5VUJ6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
LRCH2Q5VUJ6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRCH2Q5VUJ6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRCH2Q5VUJ6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRCH2Q5VUJ6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
LRCH2Q5VUJ6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRCH2Q5VUJ6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRCH2Q5VUJ6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LRCH2Q5VUJ6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRCH2Q5VUJ6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRCH2Q5VUJ6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRCH2Q5VUJ6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRCH2Q5VUJ6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRCH2Q5VUJ6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRCH2Q5VUJ6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRCH2Q5VUJ6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRCH2Q5VUJ6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRCH2Q5VUJ6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRCH2Q5VUJ6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
LRCH2Q5VUJ6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRCH2Q5VUJ6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRCH2Q5VUJ6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRCH2Q5VUJ6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRCH2Q5VUJ6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
LRCH2Q5VUJ6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRCH2Q5VUJ6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRCH2Q5VUJ6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRCH2Q5VUJ6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRCH2Q5VUJ6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRCH2Q5VUJ6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRCH2Q5VUJ6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRCH2Q5VUJ6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRCH2Q5VUJ6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
LRCH2Q5VUJ6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRCH2Q5VUJ6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
LRCH2Q5VUJ6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRCH2Q5VUJ6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRCH2Q5VUJ6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRCH2Q5VUJ6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRCH2Q5VUJ6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRCH2Q5VUJ6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRCH2Q5VUJ6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
LRCH2Q5VUJ6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRCH2Q5VUJ6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRCH2Q5VUJ6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRCH2Q5VUJ6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRCH2Q5VUJ6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRCH2Q5VUJ6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRCH2Q5VUJ6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRCH2Q5VUJ6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRCH2Q5VUJ6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRCH2Q5VUJ6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRCH2Q5VUJ6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRCH2Q5VUJ6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRCH2Q5VUJ6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms