Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q5VSD8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q5VSD8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q5VSD8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q5VSD8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q5VSD8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q5VSD8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Q5VSD8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q5VSD8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q5VSD8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q5VSD8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q5VSD8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q5VSD8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q5VSD8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q5VSD8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q5VSD8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q5VSD8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Q5VSD8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q5VSD8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q5VSD8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q5VSD8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Q5VSD8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q5VSD8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q5VSD8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q5VSD8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q5VSD8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q5VSD8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q5VSD8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q5VSD8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q5VSD8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q5VSD8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q5VSD8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q5VSD8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q5VSD8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q5VSD8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q5VSD8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Q5VSD8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q5VSD8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q5VSD8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q5VSD8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q5VSD8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q5VSD8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Q5VSD8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Q5VSD8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q5VSD8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q5VSD8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Q5VSD8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q5VSD8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q5VSD8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q5VSD8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q5VSD8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q5VSD8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q5VSD8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q5VSD8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q5VSD8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q5VSD8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q5VSD8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q5VSD8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q5VSD8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q5VSD8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q5VSD8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q5VSD8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q5VSD8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q5VSD8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q5VSD8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q5VSD8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q5VSD8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q5VSD8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q5VSD8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q5VSD8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Q5VSD8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q5VSD8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Q5VSD8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q5VSD8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q5VSD8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q5VSD8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q5VSD8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q5VSD8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q5VSD8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q5VSD8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Q5VSD8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Q5VSD8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q5VSD8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q5VSD8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q5VSD8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q5VSD8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q5VSD8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q5VSD8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q5VSD8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q5VSD8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q5VSD8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q5VSD8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q5VSD8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q5VSD8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q5VSD8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q5VSD8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q5VSD8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q5VSD8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q5VSD8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q5VSD8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms