Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TTC39AQ5SRH9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TTC39AQ5SRH9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TTC39AQ5SRH9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TTC39AQ5SRH9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TTC39AQ5SRH9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TTC39AQ5SRH9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TTC39AQ5SRH9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TTC39AQ5SRH9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TTC39AQ5SRH9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TTC39AQ5SRH9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TTC39AQ5SRH9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
TTC39AQ5SRH9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
TTC39AQ5SRH9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TTC39AQ5SRH9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TTC39AQ5SRH9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TTC39AQ5SRH9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TTC39AQ5SRH9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TTC39AQ5SRH9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TTC39AQ5SRH9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TTC39AQ5SRH9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TTC39AQ5SRH9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TTC39AQ5SRH9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TTC39AQ5SRH9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TTC39AQ5SRH9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TTC39AQ5SRH9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TTC39AQ5SRH9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TTC39AQ5SRH9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TTC39AQ5SRH9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TTC39AQ5SRH9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TTC39AQ5SRH9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TTC39AQ5SRH9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TTC39AQ5SRH9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TTC39AQ5SRH9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TTC39AQ5SRH9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TTC39AQ5SRH9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TTC39AQ5SRH9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TTC39AQ5SRH9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TTC39AQ5SRH9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TTC39AQ5SRH9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TTC39AQ5SRH9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TTC39AQ5SRH9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TTC39AQ5SRH9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TTC39AQ5SRH9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TTC39AQ5SRH9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TTC39AQ5SRH9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TTC39AQ5SRH9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TTC39AQ5SRH9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TTC39AQ5SRH9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TTC39AQ5SRH9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TTC39AQ5SRH9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TTC39AQ5SRH9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TTC39AQ5SRH9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TTC39AQ5SRH9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TTC39AQ5SRH9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TTC39AQ5SRH9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TTC39AQ5SRH9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TTC39AQ5SRH9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TTC39AQ5SRH9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TTC39AQ5SRH9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TTC39AQ5SRH9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TTC39AQ5SRH9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TTC39AQ5SRH9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TTC39AQ5SRH9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TTC39AQ5SRH9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TTC39AQ5SRH9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TTC39AQ5SRH9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TTC39AQ5SRH9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TTC39AQ5SRH9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TTC39AQ5SRH9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TTC39AQ5SRH9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TTC39AQ5SRH9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TTC39AQ5SRH9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TTC39AQ5SRH9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TTC39AQ5SRH9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TTC39AQ5SRH9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TTC39AQ5SRH9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TTC39AQ5SRH9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TTC39AQ5SRH9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TTC39AQ5SRH9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TTC39AQ5SRH9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TTC39AQ5SRH9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TTC39AQ5SRH9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TTC39AQ5SRH9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TTC39AQ5SRH9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TTC39AQ5SRH9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TTC39AQ5SRH9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TTC39AQ5SRH9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TTC39AQ5SRH9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TTC39AQ5SRH9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TTC39AQ5SRH9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TTC39AQ5SRH9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TTC39AQ5SRH9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TTC39AQ5SRH9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TTC39AQ5SRH9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TTC39AQ5SRH9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TTC39AQ5SRH9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TTC39AQ5SRH9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TTC39AQ5SRH9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TTC39AQ5SRH9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms