Protein–RNA interactions for Protein: Q5MNV8

FBXO47, F-box only protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO47Q5MNV8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FBXO47Q5MNV8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FBXO47Q5MNV8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FBXO47Q5MNV8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FBXO47Q5MNV8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FBXO47Q5MNV8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FBXO47Q5MNV8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FBXO47Q5MNV8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FBXO47Q5MNV8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FBXO47Q5MNV8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FBXO47Q5MNV8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FBXO47Q5MNV8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FBXO47Q5MNV8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FBXO47Q5MNV8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FBXO47Q5MNV8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FBXO47Q5MNV8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FBXO47Q5MNV8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FBXO47Q5MNV8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FBXO47Q5MNV8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FBXO47Q5MNV8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FBXO47Q5MNV8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FBXO47Q5MNV8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FBXO47Q5MNV8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FBXO47Q5MNV8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FBXO47Q5MNV8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FBXO47Q5MNV8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FBXO47Q5MNV8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FBXO47Q5MNV8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FBXO47Q5MNV8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FBXO47Q5MNV8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FBXO47Q5MNV8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
FBXO47Q5MNV8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FBXO47Q5MNV8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FBXO47Q5MNV8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FBXO47Q5MNV8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FBXO47Q5MNV8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FBXO47Q5MNV8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FBXO47Q5MNV8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FBXO47Q5MNV8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FBXO47Q5MNV8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FBXO47Q5MNV8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
FBXO47Q5MNV8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
FBXO47Q5MNV8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FBXO47Q5MNV8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FBXO47Q5MNV8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FBXO47Q5MNV8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FBXO47Q5MNV8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FBXO47Q5MNV8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FBXO47Q5MNV8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FBXO47Q5MNV8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FBXO47Q5MNV8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FBXO47Q5MNV8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FBXO47Q5MNV8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FBXO47Q5MNV8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FBXO47Q5MNV8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FBXO47Q5MNV8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FBXO47Q5MNV8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FBXO47Q5MNV8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FBXO47Q5MNV8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FBXO47Q5MNV8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FBXO47Q5MNV8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FBXO47Q5MNV8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FBXO47Q5MNV8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FBXO47Q5MNV8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FBXO47Q5MNV8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FBXO47Q5MNV8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
FBXO47Q5MNV8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FBXO47Q5MNV8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FBXO47Q5MNV8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FBXO47Q5MNV8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FBXO47Q5MNV8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FBXO47Q5MNV8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FBXO47Q5MNV8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FBXO47Q5MNV8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FBXO47Q5MNV8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FBXO47Q5MNV8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
FBXO47Q5MNV8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FBXO47Q5MNV8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
FBXO47Q5MNV8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FBXO47Q5MNV8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FBXO47Q5MNV8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FBXO47Q5MNV8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FBXO47Q5MNV8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FBXO47Q5MNV8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
FBXO47Q5MNV8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
FBXO47Q5MNV8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FBXO47Q5MNV8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FBXO47Q5MNV8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
FBXO47Q5MNV8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FBXO47Q5MNV8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FBXO47Q5MNV8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
FBXO47Q5MNV8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
FBXO47Q5MNV8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
FBXO47Q5MNV8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
FBXO47Q5MNV8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FBXO47Q5MNV8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FBXO47Q5MNV8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FBXO47Q5MNV8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FBXO47Q5MNV8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
FBXO47Q5MNV8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms