Protein–RNA interactions for Protein: Q5MAI5

CDKL4, Cyclin-dependent kinase-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL4Q5MAI5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKL4Q5MAI5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL4Q5MAI5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL4Q5MAI5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL4Q5MAI5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL4Q5MAI5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL4Q5MAI5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL4Q5MAI5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL4Q5MAI5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL4Q5MAI5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL4Q5MAI5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL4Q5MAI5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL4Q5MAI5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL4Q5MAI5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL4Q5MAI5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL4Q5MAI5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL4Q5MAI5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL4Q5MAI5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL4Q5MAI5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL4Q5MAI5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL4Q5MAI5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL4Q5MAI5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL4Q5MAI5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL4Q5MAI5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL4Q5MAI5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKL4Q5MAI5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKL4Q5MAI5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKL4Q5MAI5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKL4Q5MAI5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKL4Q5MAI5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKL4Q5MAI5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKL4Q5MAI5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKL4Q5MAI5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKL4Q5MAI5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKL4Q5MAI5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKL4Q5MAI5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDKL4Q5MAI5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDKL4Q5MAI5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKL4Q5MAI5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKL4Q5MAI5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKL4Q5MAI5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKL4Q5MAI5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKL4Q5MAI5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKL4Q5MAI5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKL4Q5MAI5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKL4Q5MAI5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKL4Q5MAI5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKL4Q5MAI5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKL4Q5MAI5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKL4Q5MAI5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKL4Q5MAI5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKL4Q5MAI5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKL4Q5MAI5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKL4Q5MAI5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKL4Q5MAI5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKL4Q5MAI5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKL4Q5MAI5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKL4Q5MAI5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKL4Q5MAI5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKL4Q5MAI5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKL4Q5MAI5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKL4Q5MAI5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKL4Q5MAI5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKL4Q5MAI5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL4Q5MAI5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL4Q5MAI5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL4Q5MAI5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL4Q5MAI5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL4Q5MAI5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL4Q5MAI5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL4Q5MAI5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL4Q5MAI5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL4Q5MAI5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL4Q5MAI5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL4Q5MAI5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL4Q5MAI5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKL4Q5MAI5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKL4Q5MAI5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKL4Q5MAI5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKL4Q5MAI5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKL4Q5MAI5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKL4Q5MAI5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKL4Q5MAI5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKL4Q5MAI5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKL4Q5MAI5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKL4Q5MAI5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKL4Q5MAI5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDKL4Q5MAI5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL4Q5MAI5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL4Q5MAI5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL4Q5MAI5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL4Q5MAI5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL4Q5MAI5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL4Q5MAI5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL4Q5MAI5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL4Q5MAI5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL4Q5MAI5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL4Q5MAI5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL4Q5MAI5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL4Q5MAI5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms