Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQF7

LINC01556, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01556, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01556Q5JQF7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01556Q5JQF7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC01556Q5JQF7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01556Q5JQF7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01556Q5JQF7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01556Q5JQF7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01556Q5JQF7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01556Q5JQF7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01556Q5JQF7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01556Q5JQF7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01556Q5JQF7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01556Q5JQF7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01556Q5JQF7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01556Q5JQF7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01556Q5JQF7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LINC01556Q5JQF7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01556Q5JQF7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01556Q5JQF7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01556Q5JQF7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01556Q5JQF7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01556Q5JQF7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01556Q5JQF7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01556Q5JQF7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01556Q5JQF7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01556Q5JQF7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01556Q5JQF7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01556Q5JQF7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01556Q5JQF7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01556Q5JQF7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01556Q5JQF7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01556Q5JQF7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01556Q5JQF7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01556Q5JQF7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01556Q5JQF7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01556Q5JQF7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01556Q5JQF7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01556Q5JQF7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01556Q5JQF7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01556Q5JQF7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01556Q5JQF7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01556Q5JQF7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01556Q5JQF7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01556Q5JQF7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01556Q5JQF7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01556Q5JQF7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01556Q5JQF7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01556Q5JQF7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01556Q5JQF7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01556Q5JQF7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01556Q5JQF7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01556Q5JQF7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01556Q5JQF7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01556Q5JQF7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01556Q5JQF7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01556Q5JQF7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01556Q5JQF7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms