Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM4

ZNF542P, Putative zinc finger protein 542, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF542PQ5EBM4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF542PQ5EBM4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF542PQ5EBM4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF542PQ5EBM4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF542PQ5EBM4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF542PQ5EBM4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF542PQ5EBM4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF542PQ5EBM4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF542PQ5EBM4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF542PQ5EBM4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF542PQ5EBM4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF542PQ5EBM4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF542PQ5EBM4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF542PQ5EBM4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF542PQ5EBM4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF542PQ5EBM4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF542PQ5EBM4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF542PQ5EBM4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF542PQ5EBM4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF542PQ5EBM4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF542PQ5EBM4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF542PQ5EBM4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF542PQ5EBM4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF542PQ5EBM4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF542PQ5EBM4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF542PQ5EBM4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF542PQ5EBM4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF542PQ5EBM4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF542PQ5EBM4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF542PQ5EBM4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF542PQ5EBM4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF542PQ5EBM4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF542PQ5EBM4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF542PQ5EBM4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF542PQ5EBM4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF542PQ5EBM4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF542PQ5EBM4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF542PQ5EBM4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF542PQ5EBM4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF542PQ5EBM4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF542PQ5EBM4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF542PQ5EBM4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF542PQ5EBM4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF542PQ5EBM4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF542PQ5EBM4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF542PQ5EBM4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF542PQ5EBM4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF542PQ5EBM4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF542PQ5EBM4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF542PQ5EBM4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF542PQ5EBM4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF542PQ5EBM4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF542PQ5EBM4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF542PQ5EBM4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF542PQ5EBM4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF542PQ5EBM4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF542PQ5EBM4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF542PQ5EBM4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF542PQ5EBM4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF542PQ5EBM4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF542PQ5EBM4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF542PQ5EBM4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF542PQ5EBM4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF542PQ5EBM4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF542PQ5EBM4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF542PQ5EBM4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF542PQ5EBM4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF542PQ5EBM4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF542PQ5EBM4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF542PQ5EBM4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF542PQ5EBM4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF542PQ5EBM4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF542PQ5EBM4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF542PQ5EBM4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF542PQ5EBM4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF542PQ5EBM4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF542PQ5EBM4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF542PQ5EBM4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF542PQ5EBM4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF542PQ5EBM4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF542PQ5EBM4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF542PQ5EBM4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF542PQ5EBM4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF542PQ5EBM4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF542PQ5EBM4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF542PQ5EBM4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF542PQ5EBM4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF542PQ5EBM4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF542PQ5EBM4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF542PQ5EBM4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF542PQ5EBM4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF542PQ5EBM4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF542PQ5EBM4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF542PQ5EBM4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF542PQ5EBM4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF542PQ5EBM4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF542PQ5EBM4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF542PQ5EBM4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF542PQ5EBM4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF542PQ5EBM4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.7 ms