Protein–RNA interactions for Protein: Q59EK9

RUNDC3A, RUN domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3AQ59EK9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNDC3AQ59EK9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNDC3AQ59EK9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNDC3AQ59EK9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNDC3AQ59EK9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNDC3AQ59EK9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNDC3AQ59EK9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNDC3AQ59EK9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNDC3AQ59EK9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNDC3AQ59EK9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNDC3AQ59EK9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNDC3AQ59EK9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNDC3AQ59EK9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNDC3AQ59EK9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNDC3AQ59EK9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNDC3AQ59EK9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNDC3AQ59EK9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNDC3AQ59EK9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNDC3AQ59EK9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNDC3AQ59EK9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNDC3AQ59EK9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNDC3AQ59EK9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNDC3AQ59EK9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNDC3AQ59EK9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNDC3AQ59EK9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNDC3AQ59EK9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNDC3AQ59EK9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNDC3AQ59EK9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNDC3AQ59EK9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNDC3AQ59EK9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNDC3AQ59EK9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNDC3AQ59EK9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNDC3AQ59EK9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNDC3AQ59EK9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNDC3AQ59EK9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNDC3AQ59EK9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNDC3AQ59EK9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNDC3AQ59EK9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNDC3AQ59EK9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNDC3AQ59EK9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNDC3AQ59EK9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNDC3AQ59EK9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNDC3AQ59EK9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNDC3AQ59EK9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNDC3AQ59EK9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNDC3AQ59EK9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNDC3AQ59EK9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNDC3AQ59EK9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNDC3AQ59EK9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNDC3AQ59EK9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNDC3AQ59EK9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNDC3AQ59EK9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNDC3AQ59EK9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNDC3AQ59EK9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNDC3AQ59EK9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RUNDC3AQ59EK9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUNDC3AQ59EK9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNDC3AQ59EK9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNDC3AQ59EK9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNDC3AQ59EK9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNDC3AQ59EK9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNDC3AQ59EK9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNDC3AQ59EK9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNDC3AQ59EK9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNDC3AQ59EK9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNDC3AQ59EK9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNDC3AQ59EK9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNDC3AQ59EK9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNDC3AQ59EK9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC3AQ59EK9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms