Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC9

EIPR1, EARP-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIPR1Q53HC9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EIPR1Q53HC9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EIPR1Q53HC9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EIPR1Q53HC9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EIPR1Q53HC9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EIPR1Q53HC9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EIPR1Q53HC9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EIPR1Q53HC9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EIPR1Q53HC9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EIPR1Q53HC9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EIPR1Q53HC9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EIPR1Q53HC9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EIPR1Q53HC9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EIPR1Q53HC9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EIPR1Q53HC9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EIPR1Q53HC9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EIPR1Q53HC9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EIPR1Q53HC9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EIPR1Q53HC9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EIPR1Q53HC9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EIPR1Q53HC9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EIPR1Q53HC9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EIPR1Q53HC9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EIPR1Q53HC9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EIPR1Q53HC9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EIPR1Q53HC9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EIPR1Q53HC9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EIPR1Q53HC9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EIPR1Q53HC9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EIPR1Q53HC9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EIPR1Q53HC9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EIPR1Q53HC9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EIPR1Q53HC9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EIPR1Q53HC9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EIPR1Q53HC9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
EIPR1Q53HC9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EIPR1Q53HC9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EIPR1Q53HC9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms