Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HSD17B12Q53GQ0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HSD17B12Q53GQ0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms